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Enregistrement W4393143404 · doi:10.1016/j.jbc.2024.106669

Abstract 1353 Phagosomes maturation and resolution: involvement of adaptor protein complexes

2024· article· en· W4393143404 sur OpenAlexaff
Mélanie Mansat, Muhammad Hammad Butt, Joshua P. Ferguson, Roberto J. Botelho

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSignal transducing adaptor proteinPhagosomeCell biologyChemistryBiologyPhagocytosisSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Macrophages are a diverse group of immune cells that play a major role in eliminating dangerous particles.They do this by recognizing, binding to, and then engulfing these particles through a mechanism called phagocytosis.This multistep process starts with the uptake of the particle and phagosome formation, and phagosomes subsequently mature into phagolysosomes wherein the particle is digested.Phagolysosomes then fragment to recycle membranes and reform lysosomes, ensuring the macrophages can undergo additional rounds of phagosome maturation.This final step of phagocytosis is called phagosome resolution.Even if the first steps have been extensively studied and are now well understood, the mechanisms underlying phagosome resolution remains unclear.Recently, we demonstrated that clathrin, a protein usually characterized by its role in endocytosis at the plasma membrane, is involved in phagosome fragmentation and lysosome reformation.This raised the hypothesis that other membrane fission proteins such as the adaptor proteins (AP) complexes could be involved in the recruitment of clathrin on phagosomes and phagosome resolution.Using transient genetic manipulation in macrophages cell lines to knock-down AP complexes, confocal microscopy and biochemistry, our data revealed a role of the different AP complexes in phagocytosis, from the uptake to phagosome resolution.The phagocytic uptake is reduced when AP-1 or AP-3 are silenced, whereas phagosome maturation is touched with AP-1 silencing.Interestingly, silencing the different AP complexes didn't impact the lysosomal acidification.Both AP-2 and AP-3 silencing influence phagosome resolution, but AP-2 had a stronger effect on clathrin-dependent resolution.Finally, both AP-2 and clathrin localized on the phagosomes.We are currently pursuing the hypothesis of the involvement of a lysosomal protein in the recruitment of AP-2 and subsequently clathrin to induce phagosome fragmentation.Overall, we demonstrated that the different AP complexes are regulating different steps from phagosomes' formation to their resolution.Our last results concerning the understanding of the mechanisms behind phagosome resolution will be presented.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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