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Enregistrement W4393166601 · doi:10.1016/j.jbc.2024.106361

Abstract 1646 The potential of synthetic unsaturated fatty acids as antibacterial agents: Investigating their mechanism of action against methicillin-resistant Staphylococcus aureus

2024· article· en· W4393166601 sur OpenAlexfundno aff
David J. Sanabria‐Ríos, Jazmar Villarini-Torres, Giancarlo Casillas-Vargas, Harry Rivera, Nataliya Chorna, Kathleen M. Brundage, Néstor M. Carballeira

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolism and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésStaphylococcus aureusMechanism of actionChemistryMechanism (biology)MicrobiologyAction (physics)BacteriaBiochemistryBiologyIn vitroPhilosophyEpistemology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The inner nuclear membrane (INM) can receive lipids by lateral diffusion from the outer nuclear membrane and endoplasmic reticulum (ER) at nuclear pores contacts.However, the INM and nucleoplasm also harbour phospholipid and triacylglycerol (TAG) biosynthetic enzymes, and assemble nuclear lipid droplets (nLDs) and lipid-associated PML structures (LAPS) from excess fatty acids.The CDP-choline pathway for synthesis of phosphatidylcholine, a major component of membranes and the surface monolayer of lipid droplets, terminates in the ER and Golgi apparatus but is regulated in the nucleus by the ratelimiting enzyme CTP:phosphocholine cytidylyltransferase α (CCTα).Changes in demand for phosphatidylcholine (PC) are relayed to CCTα via alterations in the structure and lipid composition of the INM and nLDs.An amphipathic helix in CCTα senses these compositional variations in the INM and nLDs and mediates enzyme translocation and activation.We treated hepatoma and osteosarcoma cells with oleate to identify factors that control the temporal association of CCTα with the INM and nLDs.The acute treatment of cells with oleate promoted translocation to the INM in 15-30 min and was accompanied by dephosphorylation of the serine-rich C-terminal P-domain.Oleate exposure for <2-3 h promoted the formation of nLDs and LAPS that gradually accumulated CCTα on their surface.The association of CCTα with nLDs and LAPS was proportional to available surface area and prevented by bulk phosphorylation of the P-domain.Blocking TAG synthesis with diacylglycerol acyltransferase inhibitors (iDGAT) trapped CCTα, Lipin1 and PML on the INM by a mechanism that was dependent on fatty acids but not DAG.Trapping CCTα on the INM of DGATi-treated cells increased its expression by inhibition of proteasomal degradation.The CCTα activators oleoyl alcohol and farnesol recapitulated these effect of oleate and DGATi.In contrast, CCTα on nLDs was not shielded against proteolytic degradation.We conclude that oleate provides the initial stimulus for CCTα association with the INM, followed by a shift to nLDs and LAPS as the surface monolayer increases due to TAG synthesis.Prolonging the acute phase of CCTα activation on the INM enhanced enzyme expression by blocking proteolytic degradation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
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