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Enregistrement W4393167676 · doi:10.1016/j.jbc.2024.107160

Abstract 2453 The Copper Network of the Cancer Metastasis Modulator MEMO1

2024· article· en· W4393167676 sur OpenAlexaffabout
Oleg Y. Dmitriev, Paria Nouri, Frederick S. Vizeacoumar, Franco J. Vizeacoumar

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Mechanisms and Therapy
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésMetastasisCopperCancer researchCell biologyChemistryCancerNeuroscienceBiologyMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MEMO1 is an evolutionary conserved protein implicated in many biological processes, however its primary molecular function remains unknown. Importantly, MEMO1 is overexpressed in many types of cancer, in particular, in breast cancer and lung cancer, and modulates cancer metastasis through altered cell motility. MEMO1 has been reported to be a copper-dependent redox-active protein. We have shown that purified MEMO1 binds copper or iron in the coordination mode characteristic of iron-containing dioxygenases. To understand the functional role of MEMO1, we have analyzed its genetic interactions using DepMap gene essentiality data and found multiple iron and copper related genes exhibiting genetic relationships with MEMO1. We have experimentally validated some of the genetic interactions using shRNA gene knockdowns. Interestingly, most of the metal related interactions of MEMO1 are of the gain-of-function type. The copper related genes showing interactions with MEMO1 fall into three main groups by function: (i) cytochrome c oxidase assembly factors (ii) cell adhesion and communication, and (iii) copper storage and transport. Although, in the cell cytosol, MEMO1 is likely to predominantly bind iron, its ability to bind either iron or copper in vitro and its network of iron and copper related genetic interactions suggest an intriguing possibility of a functional switch triggered by copper binding in a specific local environment within the cell. Taken together, our results suggest a key role for MEMO1 in regulating metal homeostasis in the cell. This research was supported by the Canadian Institutes of Health Research Project grant PJT-178246, Natural Sciences and Engineering Council of Canada Discovery grant RGPIN-782 2017-06822 to O.Y.D. and Canadian Institute of Health Research grant PJT-156309 and Canada Foundation for Innovation grant to F.J.V.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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