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Enregistrement W4393167780 · doi:10.1016/j.jbc.2024.106686

Abstract 1741 APOL7C control of protein antigen escape and cross-presentation in classical dendritic cells

2024· article· en· W4393167780 sur OpenAlexafffundabout
Gerone A. Gonzales, Song Huang, Liam Wilkinson, Cassie Wood, Johnathan Canton

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunotherapy and Immune Responses
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCross-presentationAntigenAntigen presentationCell biologyPresentation (obstetrics)Antigen-presenting cellImmunologyBiologyChemistryMedicineImmune systemT cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cross-presentation is the essential process that links the detection of “danger” by dendritic cells to the generation of potent cytotoxic T cell responses against pathogens and cancer. Despite the obvious importance of cross-presentation, the molecular pathways driving cross-presentation remain unclear. It is believed that an essential step in cross-presentation is the transfer of phagocytosed protein antigens from within the phagosomes of dendritic cells to the cytosol. We have obtained exciting new evidence using bulk RNA sequencing and qPCR that upon exposure to “danger” signals, such as viral RNA, dendritic cells increase the expression of a poorly characterized pore-forming protein called apolipoprotein 7C (APOL7C). Utilizing live cell microscopy and immunofluorescence assays, we have found that APOL7C is recruited to phagosomal membranes and, strikingly, these phagosomes begin to show signs of breached membranes shortly after the arrival of APOL7C. APOL7C arrival on phagosomes and is accompanied by the arrival endolysosomal damage markers such as galectin 3 and correlates with the escape of luminal, membrane-impermeant fluorescent dyes and fluid-phase proteins to the cytosol. We have found that APOL7C-mediated phagosomal damage leads to protein antigen export from the phagosome to the cytosol where they can be processed for cross-presentation. This work will investigate the molecular mechanisms of APOL7C recruitment to phagosomes, elucidating pathways of protein antigen escape and processing for cross-presentation, and provide insight into new avenues of vaccine and cancer therapy development. Canadian Institutes of Health Research, Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada, Canadian Cancer Society, University of Calgary Veterinary Medicine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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