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Enregistrement W4393217486 · doi:10.1021/acs.jnatprod.3c00942

Transient Receptor Potential Melastatin 7 (TRPM7) Ion Channel Inhibitors: Preliminary SAR and Conformational Studies of Xenicane Diterpenoids from the Hawaiian Soft Coral <i>Sarcothelia edmondsoni</i>

2024· article· en· W4393217486 sur OpenAlexaff
Guangmin Yao, Matthew R. Parris, Weiwei Kuo, Peter Pörzgen, Brandi Castillo, Evan S. Mason, Andres Chinchilla, Junhao Huang, Sayuri Suzuki, Rylee Ross, Ellis N.L. Akana, Savana Vander Schuit, Steven P. Miller, Reinhold Penner, Hong‐Shuo Sun, Zhong‐Ping Feng, Kenneth G. Hull, Daniel Romo, Andrea Fleig, F. David Horgen

Notice bibliographique

RevueJournal of Natural Products · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueMagnesium in Health and Disease
Établissements canadiensUniversity of TorontoBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Center for Complementary and Integrative HealthNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeAmerican Society of Pharmacognosy
Mots-clésPharmacophoreStereochemistryChemistryIon channelStructure–activity relationshipBiochemistryReceptorIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Waixenicin A, a xenicane diterpene from the octocoral Sarcothelia edmondsoni, is a selective, potent inhibitor of the TRPM7 ion channel. To study the structure–activity relationship (SAR) of waixenicin A, we isolated and assayed related diterpenes from S. edmondsoni . In addition to known waixenicins A ( 1 ) and B ( 2 ), we purified six xenicane diterpenes, 7 S,8 S -epoxywaixenicins A ( 3 ) and B ( 4 ), 12-deacetylwaixenicin A ( 5 ), waixenicin E ( 6 ), waixenicin F ( 7 ), and 20-acetoxyxeniafaraunol B ( 8 ). We elucidated the structures of 3 – 8 by NMR and MS analyses. Compounds 1, 2, 3, 4, and 6 inhibited TRPM7 activity in a cell-based assay, while 5, 7, and 8 were inactive. A preliminary SAR emerged showing that alterations to the nine-membered ring of 1 did not reduce activity, while the 12-acetoxy group, in combination with the dihydropyran, appears to be necessary for TRPM7 inhibition. The bioactive compounds are proposed to be latent electrophiles by formation of a conjugated oxocarbenium ion intermediate. Whole-cell patch-clamp experiments demonstrated that waixenicin A inhibition is irreversible, consistent with a covalent inhibitor, and showed nanomolar potency for waixenicin B ( 2 ). Conformational analysis (DFT) of 1, 3, 7, and 8 revealed insights into the conformation of waixenicin A and congeners and provided information regarding the stabilization of the proposed pharmacophore.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,292
Score d'incertitude au seuil0,548

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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