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Enregistrement W4393232244 · doi:10.26434/chemrxiv-2024-bn5sm

Self-assembly of Tyrosine-containing Peptides into Injectable Hydrogels with Distinct Nanostructures is Key in Determining Inflammatory Response of Macrophages

2024· preprint· en· W4393232244 sur OpenAlexfundno aff
Jacek K. Wychowaniec, Ezgi Irem Bektas, Jennifer Vernengo, Marcia Mürner, Marielle Airoldi, Charlotte J. C. Edwards‐Gayle, Paul Sean Tipay, Jiranuwat Sapudom, Jeremy Teo, David Eglin, Matteo D’Este

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueSupramolecular Self-Assembly in Materials
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesH2020 Excellent ScienceDivision of Materials ResearchHorizon 2020 Framework ProgrammeAO FoundationEuropean CommissionYork UniversityNew York University Abu DhabiDiamond Light SourceNational Science Foundation
Mots-clésNanofiberInflammationTyrosineNanostructureInflammatory responseCell biologyPeptideSelf-healing hydrogelsChemistryMaterials scienceNanotechnologyBiochemistryBiologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Self-assembling peptides (SAPs) are fully defined nanobiomaterials offering unprecedented opportunities to control nanostructure and chemical attributes to investigate and manipulate cellular signals. To investigate the influence of chemical and morphological characteristics on inflammatory signalling in native immunity, we designed five beta-sheet SAPs: EFEFKFEFK (EF8), YEFEFKFEFK (YEF8), YEFEFKFEFK (EF8Y), YEFEFKFEFK (YEF8Y) and EYEFKFEFK (EYF8) (F: phenylalanine; E: glutamic acid; K: lysine, Y: tyrosine). The position of tyrosine in the peptide sequence dictated the distinct self-assembly into nanostructures, with sequences EF8Y, YEF8Y, EYF8 self-assembling into thin nanofibers d≈3.8 ± 0.2 nm, YEF8 self-assembling into rod-like flat ribbons d>20 nm and EF8 (control) consisting of both types of self-assembled nanostructures. These distinct nanostructures induced contrasting inflammatory response of monocytic model THP-1 cells-derived macrophages (MΦs). Presence of soluble EF8 nanofibers (at 2 mM) induced anti-inflammatory response and polarization towards an M2 state, whereas YEF8 displayed tendency for inducing pro-inflammatory response and polarization towards M1 state. The EF8Y, YEF8Y, EYF8 SAPs did not induce an inflammatory response in our models. These results were validated using peripheral blood mononuclear cells (PBMCs)-derived MΦs from human donors, confirming the critical role of the EF8 and YEF8 SAPs as possible orchestrators of the repair of tissues or inducers of pro-inflammatory state, respectively. These findings will facilitate the utilization of this family of SAPs as immunomodulatory nanobiomaterials potentially changing the course of inflammation during the progression of various diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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