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Enregistrement W4393235048 · doi:10.3390/ijms25073740

Collagen Lattice Model, Populated with Heterogeneous Cancer-Associated Fibroblasts, Facilitates Advanced Reconstruction of Pancreatic Cancer Microenvironment

2024· article· en· W4393235048 sur OpenAlexfundno aff
Xiaoyu Song, Yuma Nihashi, Yukiko Imai, Nobuhito Mori, Noritaka Kagaya, Hikaru Suenaga, Kazuo Shin‐ya, Masamichi Yamamoto, Daiki Setoyama, Yuya Kunisaki, Yasuyuki S. Kida

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJapan Science and Technology AgencyJapan Society for the Promotion of ScienceInstitute of GeneticsJapan Agency for Medical Research and Development
Mots-clésCancer-Associated FibroblastsTumor microenvironmentExtracellular matrixStromaPancreatic cancerCancer researchDesmoplasiaFibroblastCell biologyBiologyCancer cellParacrine signallingCancerChemistryCell cultureImmunologyTumor cellsBiochemistryReceptorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is a solid-tumor malignancy. To enhance the treatment landscape of PDAC, a 3D model optimized for rigorous drug screening is essential. Within the PDAC tumor microenvironment, a dense stroma comprising a large extracellular matrix and cancer-associated fibroblasts (CAFs) is well-known for its vital role in modulating tumor growth, cellular heterogeneity, bidirectional paracrine signaling, and chemoresistance. In this study, we employed a fibroblast-populated collagen lattice (FPCL) modeling approach that has the ability to replicate fibroblast contractility in the collagenous matrix to build dense stroma. This FPCL model allows CAF differentiation by facilitating multifaceted cell-cell interactions between cancer cells and CAFs, with the differentiation further influenced by mechanical forces and hypoxia carried within the 3D structure. Our FPCL models displayed hallmark features, including ductal gland structures and differentiated CAFs with spindle shapes. Through morphological explorations alongside in-depth transcriptomic and metabolomic profiling, we identified substantial molecular shifts from the nascent to mature model stages and potential metabolic biomarkers, such as proline. The initial pharmacological assays highlighted the effectiveness of our FPCL model in screening for improved therapeutic strategies. In conclusion, our PDAC modeling platform mirrors complex tumor microenvironmental dynamics and offers an unparalleled perspective for therapeutic exploration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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