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Enregistrement W4393258688 · doi:10.24072/pcjournal.407

How does dispersal shape the genetic patterns of animal populations in European cities? A simulation approach

2024· article· en· W4393258688 sur OpenAlexafffund
Paul Savary, Cécile Tannier, Jean‐Christophe Foltête, Marc Bourgeois, Gilles Vuidel, Aurélie Khimoun, Hervé Moal, Stéphane Garnier

Notice bibliographique

RevuePeer Community Journal · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueWildlife Ecology and Conservation
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesUniversité de Franche-ComtéConcordia University
Mots-clésBiological dispersalGenetic diversityEcologyGenetic structureContext (archaeology)HabitatUrbanizationBiodiversityPopulationGeographyGene flowBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Context and objectives: Although urbanization is a major driver of biodiversity erosion, it does not affect all species equally. The neutral genetic structure of populations in a given species is affected by both genetic drift and gene flow processes. In cities, the size of animal populations determines drift and can depend on multiple processes, whereas gene flow essentially depends on the ability of species to disperse across urban areas. Considering this, we tested whether variations in dispersal constraints alone could explain the variability of neutral genetic patterns commonly observed in urban areas. Besides, we assessed how the spatial distribution of urban green spaces (UGS) and peri-urban forests acts on these patterns. Methods: We simulated multi-generational genetic processes in virtual populations of animal species occupying either UGS or forest areas (both considered as a virtual species habitat) within and around 325 European cities. We used three dispersal cost scenarios determining the ability of species to cross the least favorable land cover types, while maintaining population sizes constant among scenarios. We then assessed genetic diversity and genetic differentiation patterns for each city and each habitat types across the three cost scenarios. Results: Overall, as dispersal across the least favorable land cover types was more constrained, genetic diversity decreased and genetic differentiation increased. Across scenarios, the scale and strength of the relationship between genetic differentiation and dispersal cost-distances varied substantially, alike previously observed empirical genetic patterns. Forest areas contributed more to habitat connectivity than UGS, due to their larger area and mostly peri-urban location. Hence, population-level genetic diversity was higher in forests than in UGS and genetic differentiation was higher between UGS populations than between forest populations. However, interface habitat patches allowing individuals to move between different habitat types seemed to locally buffer these contrasts by promoting gene flow. Discussion and conclusion: Our results showed that variations in spatial patterns of dispersal, and thus gene flow, could explain the variability of empirically observed genetic patterns in urban contexts. Besides, the largest habitat areas and biodiversity sources are likely to be found in areas surrounding city centers. This should encourage urban planners to pay attention to the areas promoting dispersal movements between urban habitats (e.g., UGS) and peri-urban habitats (e.g., forests), rather than among urban habitats, when managing urban biodiversity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,139
Score d'incertitude au seuil0,270

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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