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Enregistrement W4393305143 · doi:10.21203/rs.3.rs-4139025/v1

Investigating the Roles of YWHAB in Breast Cancer

2024· preprint· en· W4393305143 sur OpenAlexaff
Lacey Winstone, Beatrice G Gatien, Vaishnavi L Gopaul, Braydon Nault, Maiti Sujit, Reid Morgan Opperman, Mousumi Majumder

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématique14-3-3 protein interactions
Établissements canadiensBrandon University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancerBreast cancerOncologyPolitical scienceMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: miR-526b and miR-655 have been shown to promote aggressive breast cancer phenotypes. Analysis of cell-free secretions of MCF7-miRNA-high cells identified eight differentially secreted proteins, including 14-3-3 Beta (YWHAB). Here, we investigated the roles of YWHAB in breast cancer and tested its potential as a biomarker. Methods: Breast tumor cell lines MCF7, SKBR3, Hs578T, MCF7-COX2 and stable miRNA-overexpressing MCF7-miR526b, MCF7-miR655, SKBR3-526b cells were used in vitro assays including mRNA, protein expression, and functional assays. In silico data was used to support our findings by identifying potential links between miRNAs and YWHAB and to test diagnostic and prognostic biomarker potential. Biomarker potential was validated using breast tumor biopsy tissue and plasma samples. Results: YWHAB expression is significantly upregulated in miRNA-overexpressing cell lines both at total RNA and secretory RNA levels. These miRNAs have previously been shown to increase cell migration. Following YWHAB-KD cell migration and proliferation decreased, E-Cad expression increased, and Vimentin decreased, evidently showing YWHAB involved in EMT. In silico data showed increased expression of YWHAB mRNA in breast cancer biopsy tissue and blood plasma and increased YWHAB protein in breast tumors. High expression of YWHAB is associated with poor breast cancer patient survival. YWHAB expression was measured in breast tissues and blood plasma and found to be significantly high in all advanced stages and hormonal subtypes of tumors, compared to control tissue. YWHAB showed high sensitivity as a tumour biomarker (AUC of 0.7340, p = 0.0012) and in combination with pri-miR526b showed strong potential as a blood biomarker (AUC of 0.711, p = 0.032). Conclusion: High expression of YWHAB is associated with poor survival. It can be used as a prognostic marker, and therapeutic target in aggressive cancers to mitigate cell migration. In combination with pri-miR526b, YWHAB is a promising blood biomarker for breast cancer detection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,109
Score d'incertitude au seuil0,638

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,418
Écart entre enseignants0,373 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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