Selective protein quantification on continuous chromatography equipment with limited absorbance sensing: A partial least squares and statistical wavelength selection solution
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Real‐time selective protein quantification is an integral component of operating continuous chromatography processes. Partial least squares models fit with spectroscopic UV‐Vis absorbance data have demonstrated the ability to selectively quantify proteins. With standard continuous chromatography equipment that is only capable of measuring absorbance at a few user‐defined wavelengths, the problem of selecting appropriate wavelengths that maximize the measurement capability of the instrument remains unaddressed. Therefore, we propose a method for selecting wavelengths for continuous chromatography equipment. We illustrate our method using sets of protein mixtures composed of bovine serum albumin and lysozyme. The first step is to refine the raw wavelength set with a statistical t ‐test and an absorbance magnitude test. Then, the wavelengths within the refined spectroscopic range are ranked. Three existing techniques are evaluated – sequential forward search, variable importance to projection scores, and the least absolute shrinkage and selection operator. The best technique (in this case, sequential forward search) determines a subset of three wavelengths for further evaluation on the BioSMB PD. We use an exhaustive approach to determine the final wavelength set. We show that soft sensor models trained from the method's wavelength selections can quantify the two proteins more accurately than from the wavelength set of 230, 260 and 280 nm, by a factor of four. The method is shown to determine appropriate wavelengths for different path lengths and protein concentration ranges. Overall, we provide a tool that alleviates the analytical bottleneck for practitioners seeking to develop advanced monitoring and control methods on standard equipment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».