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Enregistrement W4393317239 · doi:10.1002/ana.26921

HLA Associations of Intrathecal <scp>IgG</scp> Production against Specific Viruses in Multiple Sclerosis

2024· article· en· W4393317239 sur OpenAlexfundno aff
Stephan Neidhart, Benjamin Vlad, Marc Hilty, Klara Asplund Högelin, Mario Ziegler, Ernesto Berenjeno‐Correa, Ina Reichen, Pernilla Stridh, Ivan Jelčić, Mohsen Khademi, Ingrid Kockum, Mireia Sospedra, Faiez Al Nimer, Roland Martinꝉ, Ilijas Jelčić

Notice bibliographique

RevueAnnals of Neurology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMultiple Sclerosis Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEuropean Research CouncilUniversität ZürichMontreal Neurological Institute and HospitalHjärnfonden
Mots-clésMultiple sclerosisImmunologyOdds ratioHuman leukocyte antigenMedicineAlleleHaplotypeAllotypeInternal medicineAntibodyBiologyAntigenGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective Specific human leucocyte antigen (HLA) alleles are not only associated with higher risk to develop multiple sclerosis (MS) and other autoimmune diseases, but also with the severity of various viral and bacterial infections. Here, we analyzed the most specific biomarker for MS, that is, the polyspecific intrathecal IgG antibody production against measles, rubella, and varicella zoster virus (MRZ reaction), for possible HLA associations in MS. Methods We assessed MRZ reaction from 184 Swiss patients with MS and clinically isolated syndrome (CIS) and 89 Swiss non‐MS/non‐CIS control patients, and performed HLA sequence‐based typing, to check for associations of positive MRZ reaction with the most prevalent HLA alleles. We used a cohort of 176 Swedish MS/CIS patients to replicate significant findings. Results Whereas positive MRZ reaction showed a prevalence of 38.0% in MS/CIS patients, it was highly specific (97.7%) for MS/CIS. We identified HLA‐DRB1*15:01 and other tightly linked alleles of the HLA‐DR15 haplotype as the strongest HLA‐encoded risk factors for a positive MRZ reaction in Swiss MS/CIS (odds ratio [OR], 3.90, 95% confidence interval [CI] 2.05–7.46, padjusted = 0.0004) and replicated these findings in Swedish MS/CIS patients (OR 2.18, 95%‐CI 1.16–4.02, padjusted = 0.028). In addition, female MS/CIS patients had a significantly higher probability for a positive MRZ reaction than male patients in both cohorts combined (padjusted <0.005). Interpretation HLA‐DRB1*15:01, the strongest genetic risk factor for MS, and female sex, 1 of the most prominent demographic risk factors for developing MS, predispose in MS/CIS patients for a positive MRZ reaction, the most specific CSF biomarker for MS. ANN NEUROL 2024;95:1112–1126

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,310
Tête enseignante GPT0,379
Écart entre enseignants0,069 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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