Genome-wide identification of tea plant (Camellia sinensis) BAHD acyltransferases reveals their role in response to herbivorous pests
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: BAHD acyltransferases are among the largest metabolic protein domain families in the genomes of terrestrial plants and play important roles in plant growth and development, aroma formation, and biotic and abiotic stress responses. Little is known about the BAHDs in the tea plant, a cash crop rich in secondary metabolites. RESULTS: In this study, 112 BAHD genes (CsBAHD01-CsBAHD112) were identified from the tea plant genome, with 85% (98/112) unevenly distributed across the 15 chromosomes. The number of BAHD gene family members has significantly expanded from wild tea plants to the assamica type to the sinensis type. Phylogenetic analysis showed that they could be classified into seven subgroups. Promoter cis-acting element analysis revealed that they contain a large number of light, phytohormones, and stress-responsive elements. Many members displayed tissue-specific expression patterns. CsBAHD05 was expressed at more than 500-fold higher levels in purple tea leaves than in green tea leaves. The genes exhibiting the most significant response to MeJA treatment and feeding by herbivorous pests were primarily concentrated in subgroups 5 and 6. The expression of 23 members of these two subgroups at different time points after feeding by tea green leafhoppers and tea geometrids was examined via qPCR, and the results revealed that the expression of CsBAHD93, CsBAHD94 and CsBAHD95 was significantly induced after the tea plants were subjected to feeding by both pricking and chewing pests. Moreover, based on the transcriptome data for tea plants being fed on by these two pests, a transcriptional regulatory network of different transcription factor genes coexpressed with these 23 members was constructed. CONCLUSIONS: Our study provides new insights into the role of BAHDs in the defense response of tea plants, and will facilitate in-depth studies of the molecular function of BAHDs in resistance to herbivorous pests.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».