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Enregistrement W4393404022 · doi:10.21203/rs.3.rs-4119428/v1

Notch signalling plays a role in patterning the ventral mesoderm during early embryogenesis in Drosophila melanogaster

2024· preprint· en· W4393404022 sur OpenAlexafffund
Marvel Megaly, Gregory Foran, Arsala Ali, Anel Turgambayeva, Ryan D. Hallam, Ping Liang, Aleksandar Necakov

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensBrock University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésMesodermDrosophila melanogasterEmbryogenesisCell biologyNotch signaling pathwayBiologyFGF and mesoderm formationAnatomyEmbryoEmbryonic stem cellGastrulationSignal transductionGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Notch signaling is a critical regulator of multiple developmental processes through its ability to control gene expression, and thereby influence cell fate specification and cell proliferation, through direct cell-cell communication. Although Notch signalling has been implicated in myogenesis during late embryogenesis, the role of Notch signalling in early mesoderm development has been largely unexplored. Endocytosis of the Notch ligand Delta and the Notch receptor extracellular domain, a critical step in Notch pathway activation, has been extensively observed in the ventral mesoderm of the early Drosophila embryo, indicating a potential for Notch signalling activity in this early germ layer. Here we present evidence that genes critical to mesoderm development require and are responsive to Notch signalling activity. Using a novel light-inducible Optogenetic variant of the Notch intracellular domain (OptoNotch), which affords precise spatial and temporal control over ectopic activation of Notch signalling. Using a combination of high-resolution fluorescent RNA in situ hybridization and qPCR, we identified a set of mesodermal genes that are directly regulated by Notch signalling. We also provide evidence that Notch signalling indirectly regulates the dorsal-ventral patterning program mediated by the Toll signalling pathway through the Dorsal/ Twist/ Snail network. Our findings demonstrate that Notch signalling regulates ventral mesoderm patterning and is critical for establishing the mesoderm-mesectoderm-ectoderm boundary by regulating gene expression patterns and providing negative feedback on the upstream patterning network.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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