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Enregistrement W4393424733 · doi:10.5281/zenodo.3724192

NSD_hypothalamus_atlas

2020· dataset· en· W4393424733 sur OpenAlexaffabout
Jürgen Germann, Clemens Neudorfer, Gavin J.B. Elias, Alexandre Boutet, Robert Gramer, Andrés M. Lozano

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2020
Typedataset
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueRadioactive Decay and Measurement Techniques
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAtlas (anatomy)HypothalamusBiologyNeuroscienceAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study describes a high-resolution in-vivo magnetic resonance imaging atlas of the human hypothalamus.<br> <br> We employed a minimum deformation averaging (MDA) pipeline to produce a normalized (MNI152b), high-resolution template from multimodal (T1w and T2w) magnetic resonance imaging (MRI) datasets. 990 subjects derived from the HCP1200 date release were included in this study.<br> This template was used to delineate hypothalamic (n=13) and extrahypothalamic (n=12) gray and white matter structures.<br> <br> Files (in bold) of the hypothalamus atlas segmentation (tables (.csv) and images (nifti format)):<br> -a table with the structure name, abbreviation and label number:<br> <strong>Volumes_names-labels.csv</strong><br> -the full volume segmentation in 0.25 and 0.5 millimeter isotropic resolution:<br> <strong>atlas_labels_0.25mm.nii.gz</strong><br> <strong>atlas_labels_0.5mm.nii.gz</strong><br> -an archive of binary images of each structure separately:<br> <strong>isolated_nuclei_0.25mm_resolution.zip</strong><br> <br> The high-contrast, high-resolution MDA template images in 0.25 and 0.5 millimeter isotropic resolution:<br> <strong>MDA_990HCP_t1_MNI152b_0.25.nii.gz<br> MDA_990HCP_t1_MNI152b_0.5.nii.gz<br> MDA_990HCP_t2_MNI152b_0.25.nii.gz<br> MDA_990HCP_t2_MNI152b_0.5.nii.gz</strong><br> <br> Tables that describe the average structure volumes in the subjects used to generate the MDAs:<br> <strong>Average_left_right_hemispheric_hypothalamic_volumes_by_Sex.csv<br> Average_left_right_hemispheric_hypothalamic_volumes.csv</strong> <strong>Estimated_volumes_of_hypothalamus_proper_its_divisions_and_nuclei.csv</strong> Authors: Clemens Neudorfer, Jürgen Germann, Gavin J.B. Elias, Alexandre Boutet, Robert Gramer, Andres M. Lozano Affiliations:<br> Division of Neurosurgery, Depatment of Surgery, Toronto Western Hospital, University of Toronto, Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,048
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0310,019

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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