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Enregistrement W4393476591 · doi:10.5281/zenodo.10103387

S74 | REFTPS | Transformation Products and Reactions from Literature

2023· dataset· en· W4393476591 sur OpenAlexaff
Emma Schymanski, Anca Baesu, Parviel Chirsir, Paul Löffler

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2023
Typedataset
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiqueChemical Reactions and Isotopes
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransformation (genetics)Chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This is the collection associated with list S74 REFTPS Transformation Products and Reactions from Literature on the NORMAN Suspect List Exchange. https://www.norman-network.com/nds/SLE/ This dataset is designed to provide an entry point for users to contribute transformation products and reactions documented in the literature for addition to the NORMAN SLE, SusDat and the PubChem Transformations section. Change logs and version tracking at the ECI GitLab site. Change log: v0.0.2 added InChIKey file. v0.1.0 added new reactions from Anca Baesu and DTXSIDs. v0.2.0 added PFAS TPs from Parviel Chirsir. v0.2.1 more PFAS TPs from Parviel. v0.3.0 Emma added HMMM TPs; v0.3.1 updated references and added new CIDs; added new MS/MS file. v0.4.0 new PFAS TPs plus MS/MS and NMR. v0.4.1 new CID added, plus CID 67543 updated to 14571268. v0.5.0 new 8:2 FT TPs plus annotation data; new structures. v0.5.1 added new CIDs. v0.5.2 added 2:2 to 6:2 FT TPs, updated ref for Bugsel. v0.5.3: added new CIDs. v0.6.0 added new structures. v0.7.0 added more new structures. v 0.7.1: updated CIDs in substances, fixed PFHpA mapping in transformations (some were mismapped to CID 67819). v 0.7.2: updated Biosystem description for many records. v0.8.0: updated CID 163201609 => 166001338, adjusted last 4 MS/MS, added Barisci AOP transformations. v0.9.0 added new structures. v0.9.1 updated CIDs and added radical structures from deposition. v0.10.0 added new irgarol reaction; v0.10.1 added new CID. v0.11.0 added Avendano and Mabury transformations from Parviel. v0.12.0 added Washington MS/MS and Marjanovic MS/MS and reactions. v0.13.0 added Galaxolide transformation. v0.14.0 added Zweigle PFAS TPs with MSMS. v0.14.1 added new CIDs. v0.15.0 added antibiotic TPs from Paul Löffler, SLU, incl. entries with no CID. v0.15.1 added new CIDs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,013

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,110
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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