EWINA_RICH : a database of EarthWorm native and alien species richness accross North America
Notice bibliographique
Résumé
EWINA_RICH gathers data on observed and predicted native and alien species richness of earthworms species across geographical units of North America (Mexico, US and Canada), based on data from 1850 to 2021. Please refer to the published paper for the details about the process to produce the predictions and the general interpretation of the results. Data are given at two distinct spatial resolutions - Data at the resolution of counties or equivalent EWINA_counties.geojson: Spatial layer of all counties or alike geographical units, with environmental covariates. Used to map geographical units and to predict RASR. EWINA_2000_counties_obs.csv: Observed earthworm species richness and RASR (Relative Alien Species Richness) in the geographical units with earthworm data, since year 2000, together with the environmtal covariates.(Coverage based estimates, used in the paper, will be released soon, feel free to reach out if you need them). EWINA_2000_counties_pred.csv: Predicted earthworm RASR (Relative Alien Species Richness) and its uncertainty, in all counties or equivalent, based on a model fitted on data after the year 2000. - Data at the resolution of TDWG4 geographical units (≈ states) see the Biodiversity Information Facility Website for more info about the definition of TDWG4 geographical units EWINA_TDWG4_aboveground.geojson: Spatial layer of TDWG4 geographical units, with above ground alien taxa richness from Dawson 2017 https://doi.org/10.1038/s41559-017-0186. EWINA_TDWG4_earthworms_YYYY.csv: Observed earthworm native and exotic species richness in the TDWG4 units, data cumulated from 1850 to YYYY. EWINA_TDWG4_fun.csv: Observed native and alien earthworm species functionnal role in the TDWG4 units, data cumulated from 1850 to 2021. All data files are provided with a readme file that explains the meaning of the variables. Scripts to use the data are stored on GitHub: https://github.com/JeromeMathieuEcology/GlobalWorming
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,008 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,018 | 0,006 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».