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Enregistrement W4393596778 · doi:10.5281/zenodo.7393174

Datasets of "Influence of contrast and texture based image modifications on the performance and attention shift of U-Net models for brain tissue segmentation" Part 7 of 14

2022· dataset· en· W4393596778 sur OpenAlexaboutno aff
Suhang You, Mauricio Reyes

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2022
Typedataset
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueBrain Tumor Detection and Classification
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen Forschung
Mots-clésContrast (vision)Texture (cosmology)SegmentationArtificial intelligenceComputer sciencePattern recognition (psychology)Image (mathematics)Image textureBrain tissueComputer visionImage segmentationPsychologyNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This dataset is part of the work https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fnimg.2022.1012639/full. This is the seventh part of 14 parts of the full dataset (7/14). It contains 3 sets of simulated T1 weighted brain volumes in 3 simulated scanning sequences of spin-echo. The parameters of simulated scanning sequences are respectively repetition time (TR) = 300ms, 400ms, 500ms, and echo time (TE) = 40ms. Under <strong>each</strong> simulated scanning sequence, there are 500 brain volumes. The segmentation labels for each tissue are contained in the first part which you may find at https://zenodo.org/record/7294916 The simulation process of this dataset involves two processes. The first is to simulate one brain under different simulated scanning sequences. For this, we use BrainWeb https://brainweb.bic.mni.mcgill.ca/cgi/bw/submit_request. In the custom setting, we use spin-echo and apply image artifact the same as the default setting of this page. The second process is to transform each simulated brain from BrainWeb to different anatomical shapes. We use Human Connectome Project (HCP) 1200 subject data https://www.humanconnectome.org/study/hcp-young-adult and randomly select 500 brains as anatomical references. Other details of this dataset can be found at https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fnimg.2022.1012639/full where the details of the data construction are discussed. All parts of the whole dataset can be found at: Part 1: https://zenodo.org/record/7294916 Part 2: https://zenodo.org/record/7389550 Part 3: https://zenodo.org/record/7390382 Part 4: https://zenodo.org/record/7390741 Part 5: https://zenodo.org/record/7391205 Part 6: https://zenodo.org/record/7393060 Part 7: https://zenodo.org/record/7393174 Part 8: https://zenodo.org/record/7393347 Part 9: https://zenodo.org/record/7394250 Part 10: https://zenodo.org/record/7394667 Part 11: https://zenodo.org/record/7394939 Part 12: https://zenodo.org/record/7395031 Part 13: https://zenodo.org/record/7395620 Part 14: https://zenodo.org/record/7395622

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,495
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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