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Enregistrement W4393643546 · doi:10.5281/zenodo.3942115

NSD_atlas_of_hypothalamic_region

2020· dataset· en· W4393643546 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2020
Typedataset
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueRadioactive Decay and Measurement Techniques
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAtlas (anatomy)CartographyGeographyGeologyPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<pre>This study describes a high-resolution in-vivo magnetic resonance imaging atlas of the human hypothalamic region. We employed a minimum deformation averaging (MDA) pipeline to produce a normalized (MNI152b), high-resolution template from multimodal (T1w and T2w) magnetic resonance imaging (MRI) datasets. 990 subjects derived from the HCP1200 data release were included in this study. This template was used to delineate hypothalamic (n=13) and extrahypothalamic (n=12) gray and white matter structures. The high-contrast, high-resolution MDA template images in 0.25 and 0.5 millimeter isotropic resolution: MDA_990HCP_t1_MNI152b_0.25.nii.gz MDA_990HCP_t1_MNI152b_0.5.nii.gz MDA_990HCP_t2_MNI152b_0.25.nii.gz MDA_990HCP_t2_MNI152b_0.5.nii.gz Files of the hypothalamic region atlas segmentation (tables (.csv) and images (nifti format)): -a table with the structure name, abbreviation and label number: Volumes_names-labels.csv -the full volume segmentation in 0.25 and 0.5 millimeter isotropic resolution: MDA_990HCP_atlas_labels_0.25mm.nii.gz MDA_990HCP_atlas_labels_0.5mm.nii.gz -an archive of binary images of each structure separately: MDA_990HCP_isolated_nuclei_0.25mm_resolution.zip -an archive of the three example clinical datasets containing the three labels delineating the volume of tissue activated (VTA) of the two DBS patients (example 1 Alzheimer patient with forniceal DBS; example 2 patient receiving DBS for morbid obesity) and the label delineating the metastasis of example 3. These labels are provided in MNI152b space for two reasons: 1) to allow for visualization of the label in relation to the hypothalamic atlas 2) to protect patient confidentiality example_labels_MNI152_template_space.zip A set of the final hypothalamic region atlas segmentation is also provided aligned to the MNI152 2009b template: -the full volume segmentation in 0.25 and 0.5 millimeter isotropic resolution: MNI152b_atlas_labels_0.25mm.nii.gz MNI152b_atlas_labels_0.5mm.nii.gz -an archive of binary images of each structure separately: MNI152b_isolated_nuclei_0.25mm_resolution.zip MNI152b_isolated_nuclei_0.5mm_resolution.zip Tables that describe the average structure volumes in the subjects used to generate the MDAs: Average_hypothalamic_volumes_by_Sex.csv Average_left_right_hemispheric_hypothalamic_volumes.csv Estimated_volumes_of_hypothalamus_proper_its_divisions_and_nuclei.csv Authors: Clemens Neudorfer, Jürgen Germann, Gavin J.B. Elias, Robert Gramer, Alexandre Boutet, Andres M. Lozano Affiliations: Division of Neurosurgery, Depatment of Surgery, Toronto Western Hospital, University of Toronto, Canada. </pre>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0130,013

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle