GFP Production and Purification
Notice bibliographique
Résumé
Huntington’s Disease (HD) is a hereditary neurodegenerative disease. The cause of this disease is a CAG repeat extension in the HTT Gene. This extension is then translated into an elongation of exon 1 which is primarily composed of a disordered PolyQ repeat. Although the cause is known, the mechanism by which this extension affects the function of Huntingtin (HTT), the protein produced by the HTT Gene, has yet to be understood. A part of this difficulty is our lack of understanding of the role of normal HTT in our cells. During the production of pure HTT sample, we began to notice an accumulation of nucleic acid material. To test the identity of this material, we sent it to one of our collaborators who told us it was RNA. Now, we are interested in preforming CLIP-seq to identify the specific sequence bound to HTT. Standard expression methods have been found to have minimal success due to the sheer size of HTT so other methods are being explored. One of which, is inserting formed protein into the neuronal cells via electroporation as described by Lambert, H. et. al. in Electroporation - mediated uptake of proteins into mammalian cells . By importing tagged protein into neuronal cells, we hope to capture a more readable RNA sequence, giving us a clue about its cellular function. To get the protein into the cell, we are planning to use electroporation. This process can be quite variable dependent upon the equipment used and the cells used, etc. we are using GFP to optimize conditions as it is quite easy to image in cells. In order to continue with this, a concentrated GFP sample must be made.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,015 | 0,036 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».