MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4393790811 · doi:10.5281/zenodo.4436325

Activin A receptor, type I (ACVR1); A Target Enabling Package

2020· dataset· en· W4393790811 sur OpenAlexaff
Eleanor Williams, R.J. Adamson, Jong Fu Wong, Alison Howarth, T. Krojer, David Smil, David McLeod, Ahmed Mamai, So Young Kim, Brian J. Wilson, Taira Kiyota, Ahmed Aman, Julie Owen, Gennady Poda, Kurumi Y. Horiuchi, Ekaterina Kuznetsova, Haiching Ma, J. Hamblin, Sue Cramp, Owen G Roberts, A.M. Edwards, Lisa Rooney, David Uehling, Rima Al‐awar, Jeff A. O’Meara, Methvin Isaac, F. von Delft, Alex N. Bullock

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2020
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueTGF-β signaling in diseases
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesWellcome
Mots-clésActivin receptorReceptorInternal medicineMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Germline gain of function mutations in the gene ACVR1 encoding the BMP receptor ALK2 lead to the rare congenital syndrome FOP in which aberrant signalling through the BMP signalling pathway leads to progressive heterotopic ossification in muscle and connective tissue. Identical somatic mutations have been identified in 25% of cases of the childhood brain tumour DIPG. Both conditions affect young children and have no approved therapies. Highly selective ALK2 kinase inhibitors are therefore desirable to achieve chronic treatment of children with safety. We prepared recombinant ALK2 kinase domain and solved structures of ALK2 in complex with new ATP-competitive inhibitors. We identified a novel allosteric pocket in the ALK2 kinase domain and took advantage of these structures to perform crystallographic fragment screening (XChem) using both a standard poised fragment library and a new mini-fragment library. This work identified a poised fragment for development as an allosteric ALK2 inhibitor, as well as mini-fragments exploiting new areas of the ATP and substrate binding pockets. In vitro and cellular assays are available to advance these compounds for drug development in collaboration with patient groups.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,210

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0630,044

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFigshareMême sujetTGF-β signaling in diseasesTravaux en français237 207