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Enregistrement W4393820008 · doi:10.5281/zenodo.5719452

dMRI data from the PRIME-DE processed by mrHARDIflow

2021· dataset· en· W4393820008 sur OpenAlexaff
Alex Valcourt Caron

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2021
Typedataset
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced MRI Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPrime (order theory)Computer scienceMathematicsCombinatorics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This dataset contains processed diffusion MRI data of primate subjects, DTI[1], DIAMOND[2] and fODF[3] reconstruction and metrics. Subjects included in the dataset come from 3 sites of the PRIME-DE[4] database, specifically Aix-Marseille, UC-Davis and Mount Sinai - Philips. The data was processed using mrHARDIflow[5], a pipeline tailored to process high resolution diffusion data. Please, cite the paper, as well as the PRIME-DE paper, if you use any data available here in your research. LeBihan, D., Mangin, J.-F., Poupon, C., Clark, C. A., Pappata, S., Molko, N., et al. (2001). Diffusion tensor imaging: Concepts and applications. Journal of Magnetic Resonance Imaging 13, 534–546. doi:10.1002/jmri.1076 Scherrer, B., Schwartzman, A., Taquet, M., Sahin, M., Prabhu, S. P., and Warfield, S. K. (2016). Characterizing brain tissue by assessment of the distribution of anisotropic microstructural environments in diffusion-compartment imaging (diamond). Magnetic Resonance in Medicine 76, 963–977. doi:10.1002/mrm.25912 Tournier, J.-D., Calamante, F., and Connelly, A. (2007). Robust determination of the fibre orientation distribution in diffusion mri: Non-negativity constrained super-resolved spherical deconvolution. NeuroImage 35, 1459–1472. doi:10.1016/j.neuroimage.2007.02.016 Milham, M. P., Ai, L., Koo, B., Xu, T., Amiez, C., Balezeau, F., et al. (2018). An open resource for non-human primate imaging. Neuron 100, 61–74. doi:10.1016/j.neuron.2018.08.039 Valcourt Caron, A., Shmuel, A., Hao, Z., and Descoteaux, M. (2021). mrHARDIflow : A pipeline tailored for the preprocessing and analysis of Multi-Resolution High Angular diffusion MRI and its application to a variability study of the PRIME-DE database. bioRxiv. doi:10.1101/2021.11.22.469616

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,109

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0330,054

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
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