PIAS1 (full length) Purification
Notice bibliographique
Résumé
Huntington’s Disease (HD) is a hereditary neurodegenerative disease. The cause of this disease is a CAG repeat extension in the HTT Gene. This extension is translated into an elongation of exon 1 in Huntingtin protein. Although we know the cause, the mechanism of this disease still eludes us. A part of the difficulty is our lack of understanding of the role of normal HTT in our cells. We at the SGC have set out to explore the HTT interactome to further our understanding of the role of HTT. This will give us a better basis for further study of mutant Huntingtin. Our first step on this journey was to conduct a literature review alongside a BioID experiment to come up with a list of putative huntingtin interaction partners. One of the hits on the list was PIAS1. This means that we must obtain a pure sample of PIAS1 for use in future experiments to further validate the claim that these proteins interact. Previously, I purified a shorter construct of PIAS1 in E. coli : 10.5281/zenodo.3367282. At the SGC we have access to many different constructs of the same protein. The previously purified product was only a portion of the full protein. For physiological relevance, it is important to test full length proteins so we decided to order another purification of PIAS1, and this time try to purify the whole protein.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,015 | 0,028 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».