BioDeepTime: database and compilation code
Notice bibliographique
Résumé
The archive includes copies, compilation code, documentation and temporary data files for the BioDeepTime database. <strong>Deposited files:</strong> Relational database in SQLite format: <code>biodeeptime_sqlite.zip</code>. Denormalized database in zipped .csv format: <code>biodeeptime_csv.zip</code> Denormalized database in zipped .parquet (v1.0) format: <code>biodeeptime_parquet.zip</code>. Denormalized database in .rds (R version 4.0) format: <code>biodeeptime.rds</code>. Description of tables and columns: <code>biodeeptime.md.</code> Database schema: <code>schema.pdf.</code> Synonymy of sources: <code>Synonymy of sources.xlsx.</code> Change log and known issues: <code>NEWS.md</code> Compilation files: <code>bdt_compilation.zip</code> References in .csv format: <code>references.csv</code> References in .rds format: <code>references.rds</code> Reference bibtex entries: <code>references.bib</code> Bchron ages calculated for Neotoma: <code>neotoma_bchron.rds</code> This repository accompanies the study <em>BioDeepTime: a database of biodiversity time series for modern and fossil assemblages</em> by Smith et al. (In Press).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,011 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».