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Enregistrement W4393901538 · doi:10.1101/2024.03.27.586996

The Hyaluronan Synthase isoforms direct distinct patterns of fibroblast activation linked to fibrosis progression versus resolution following renal ischaemia

2024· preprint· en· W4393901538 sur OpenAlexaff
I. V. Grigorieva, Adam C. Midgley, Charlotte Brown, Gilda Chevez, A. Williams, Dominic Manetta-Jones, Timothy Bowen, Deva D. Chan, Anna Plaas, Rafael Chevez, Robert Steadman, Usman Khalid, Soma Meran

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesHealth and Care Research WalesMedical Research CouncilUniversity of Pennsylvania
Mots-clésGene isoformFibroblastFibrosisIschemiaCell biologyMedicineCancer researchPathologyChemistryInternal medicineEndocrinologyBiologyBiochemistryGeneIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Background The stroma plays a key role during renal development and in regeneration after injury. However, following injury, the stroma expands driving progressive fibrosis. Hyaluronan (HA) is a glycosaminoglycan that is absent in healthy kidney stroma but highly expressed in disease. To understand strategies to modulate stromal HA towards therapeutic advantage, this study compares HA and HA Synthase (HAS) enzyme expression in kidney development, health, disease, and recovery. Methods Rats underwent ischaemia reperfusion injury (IRI) with/without ischaemic preconditioning (IPC) and kidneys histologically analysed. Kidneys from C57BL/6 embryos and HAS1/3 -/- mice were also analysed and parallel mechanistic cell studies performed using primary human fibroblasts. Results In health, stromal HA was absent from the renal cortex. HAS1 was expressed in some epithelial cells, whilst HAS2 was not expressed. Following IRI there was increased stromal HA in areas of chronic fibrosis, alongside increased HAS2 (but not HAS1) expression. In contrast, during development prominent stromal HA matrices were evident in areas of tubular generation, with strong HAS1 (not HAS2) expression. Following IPC+IRI, stromal HA and HAS2 were attenuated; whilst HAS1 + cells expanded but were distinct from α-SMA + myofibroblasts. Cell studies demonstrated that HAS1 + fibroblasts had a functionally distinct phenotype, with enhanced migration and FAP expression but attenuated α-SMA, EDA-FN and COL1A1 expression, whereas HAS2 + fibroblasts demonstrated a classic α-SMA + contractile myofibroblast phenotype with high EDA-FN and COL1A1. Conclusions HA is a key regulator of stromal fibroblast heterogeneity, with HAS1 and HAS2 defining phenotypically distinct populations that may influence divergent renal outcomes following injury. SIGNIFICANCE STATEMENT Hyaluronan (HA) is a matrix glycosaminoglycans that is absent in healthy kidney cortex but demonstrates increased expression in the renal stroma during progressive fibrosis. This study makes comparisons of HA accumulation, localisation, and HA Synthase (HAS) protein expression during kidney development, in health, following ischaemic kidney injury and during renal recovery. The study identifies that different HAS isoenzymes (HAS1 and HAS2) mediate distinct functional fibroblast phenotypes in vitro and are localised in distinct stromal localisations and cell sub-populations in vivo . The data provides interesting insights into HA dependent regulation of fibroblast stromal heterogeneity and identifies the novel finding that HAS1 defines cell populations that are associated with kidney recovery following ischaemic injury and are protective against progressive renal fibrosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
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