Effect modification by sex of genetic associations of vitamin C related metabolites in the Canadian Longitudinal Study on Aging
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Vitamin C is an essential dietary factor. There have been observed sex differences in serum vitamin C concentrations but the reason for this is not fully known. To understand how environmental factors like vitamin C intake interact with molecular processes, levels of metabolites can be used. Two metabolites associated with vitamin C are O-methylascorbate and ascorbic acid 2 sulfate. Past research has found there are genetic factors that influence these metabolite levels. Here, we aimed to investigate if there is effect modification by sex of these gene-metabolite associations and characterize the biological function of these interactions. We included individuals of European descent from the Canadian Longitudinal Study on Aging with available genetic and metabolic data (n= 9004). We conducted a genome wide association study with and without a sex interaction using mixed linear models. We also investigated the biological function of the important gene-sex interactions found for each metabolite. Two genome-wide statistically significant (p-value < 5×10 -8 ) interaction effects and several suggestive (p-value < 10 -5 ) interaction effects were found. The suggestive interaction associations were mapped to several genes including HSD11B2 , which is associated with sex hormones and AGRP that helps initiate hunger drive. By understanding the genetic factors that impact metabolites associated with vitamin C, we better understand its function in disease risk. In addition, highlighting genetic markers and genes whose effects are modified by sex can help to understand the mechanisms behind sex differences in vitamin C levels and guide further research.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».