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Enregistrement W4393991799 · doi:10.1111/vox.13625

<scp>SARS‐CoV‐2</scp> immunoassays in a predominantly vaccinated population: Performances and qualitative agreements obtained with two analytical approaches and four immunoassays

2024· article· en· W4393991799 sur OpenAlexaff
Christian Renaud, Antoine Lewin, Yves Grégoire, Nathalie Simard, Émilie Vallières, Maude Paquette, Steven J. Drews, Sheila F. O’Brien, Clara Di Germanio, Michael P. Busch, Marc Germain, Renée Bazin

Notice bibliographique

RevueVox Sanguinis · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensCanadian Blood ServicesCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversity of AlbertaHéma-Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSeroprevalenceMedicineSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)AntibodyPopulationSerologyVirologyImmunologyInternal medicineDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND OBJECTIVES: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) serosurveys are typically analysed by applying a fixed threshold for seropositivity ('conventional approach'). However, this approach underestimates the seroprevalence of anti-nucleocapsid (N) in vaccinated individuals-who often exhibit a difficult-to-detect anti-N response. This limitation is compounded by delays between the onset of infection and sample collection. To address this issue, we compared the performance of four immunoassays using a new analytical approach ('ratio-based approach'), which determines seropositivity based on an increase in anti-N levels. MATERIALS AND METHODS: Two groups of plasma donors and four immunoassays (Elecsys total anti-N, VITROS total anti-N, Architect anti-N Immunoglobulin G (IgG) and in-house total anti-N) were evaluated. First-group donors (N = 145) had one positive SARS-CoV-2 polymerase chain reaction (PCR) test result and had made two plasma donations, including one before and one after the PCR test (median = 27 days post-PCR). Second-group donors (N = 100) had made two plasma donations early in the Omicron wave. RESULTS: Among first-group donors (97.9% vaccinated), sensitivity estimates ranged from 60.0% to 89.0% with the conventional approach, compared with 94.5% to 98.6% with the ratio-based approach. Among second-group donors, Fleiss's κ ranged from 0.56 to 0.83 with the conventional approach, compared with 0.90 to 1.00 with the ratio-based approach. CONCLUSION: With the conventional approach, the sensitivity of four immunoassays-measured in a predominantly vaccinated population based on samples collected ~1 month after a positive test result-fell below regulatory agencies requirement of ≥95%. The ratio-based approach significantly improved the sensitivities and qualitative agreement among immunoassays, to the point where all would meet this requirement.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,175
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,076
Tête enseignante GPT0,377
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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