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Enregistrement W4394049905 · doi:10.5281/zenodo.8091569

Data files for manuscript "Elucidating the clinical and molecular spectrum of SMARCC2-associated NDD in a cohort of 65 affected individuals"

2023· dataset· en· W4394049905 sur OpenAlexaff
Bernt Popp, Elisabeth Bosch, Andrea Accogli, Georgia Vasileiou

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2023
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCohortMedicinePsychologyComputational biologyComputer scienceBiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

# 2023-06-28 # Data files for manuscript "Elucidating the clinical and molecular spectrum of SMARCC2-associated NDD in a cohort of 65 affected individuals" # Summary This ZIP-file contains the supplementary files of our SMARCC2 study "Elucidating the clinical and molecular spectrum of SMARCC2-associated NDD in a cohort of 65 affected individuals". Suppl. File S2 contains comprehensive clinical data Suppl. File S3 contains comprehensive genetic data Suppl. File S4 contains files of the SMARCC2 N-terminal homology model # Folder structure ./ (parent directory containing this README file and all subfolders) ./Files/ (contains Excel Suppl. File S2 and Suppl.File S3, and ZIP Suppl.File S4) # Files and checksums Algorithm Hash Path --------- ---- ---- MD5 003A879AA75CF8B5C4E3E05F76C4EB4C SMARCC2-Supplementary\Files\FileS2_cases_clinical-table.xlsx MD5 73B4F9E83419A8404345101CAA4D2205 SMARCC2-Supplementary\Files\FileS3_variants-and-domains.xlsx MD5 B0A12F36B4801EB6C4D21BA02B4270BB SMARCC2-Supplementary\Files\FileS4_SMARCC2 N-terminal homology model.zip

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,029
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,794
Score d'incertitude au seuil0,294

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,029
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0030,006
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,7940,405

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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