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Enregistrement W4394065252 · doi:10.1101/2024.04.02.587833

Terroir and rootstock effects on leaf shape in California Central Valley vineyards

2024· preprint· en· W4394065252 sur OpenAlexaff
Zoë Migicovsky, Joel F. Swift, Mani Awale, Zachary Helget, Laura L. Klein, Leah Pinkner, Karoline Woodhouse, Peter Cousins, Anne Fennell, Allison J. Miller, Daniel H. Chitwood

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueHorticultural and Viticultural Research
Établissements canadiensAcadia UniversityDalhousie University
Organismes subventionnairesSaint Louis UniversityPennsylvania State UniversityUniversity of MissouriNational Science Foundation
Mots-clésRootstockBiologyLeaflet (botany)ShootViticultureHorticultureBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Embedded in a single leaf shape are the latent signatures of genetic, developmental, and environmental effects. In viticulture, choice of location and rootstock are important decisions that affect the performance and production of the shoot. We hypothesize that these effects influence plant morphology, as reflected in leaf shape. We sample 1879 leaves arising from scion and rootstock combinations from commercial vineyards in the Central Valley of California. Our design tests 20 pairwise contrasts between Cabernet Sauvignon and Chardonnay scions from San Joaquin, Merced, and Madera counties from vines grafted to Teleki 5C, 1103 Paulsen, and Freedom rootstocks. Using geometric morphometric approaches, we visualize a morphospace in which, in addition to clear separation of Cabernet Sauvignon and Chardonnay scion leaf shapes, an orthogonal source of shape variation affects both varieties. Comparing the Procrustes distances to within and between group means, the additional source of variance is found to arise from location and rootstock effects. We describe and visualize a specific shape feature, the angle of the proximal lobe to the midvein that defines the closure of the petiolar sinus, that is attributable to location and rootstock effects and orthogonal to and separate from genetic, developmental, or allometric effects attributable to leaf size. Societal Impact Statement (EN) The innumerable effects of terroir—including climate, soil, microbial environment, biotic interactions, and cultivation practice—collectively alter plant performance and production. A more direct agricultural intervention is grafting, in which genetically distinct shoot and root genotypes are surgically combined to create a chimera that alter shoot performance at a distance. Selection of location and rootstock are intentional decisions in viticulture to positively alter production outcomes. Here, we show that terroir and rootstock alter the shapes of grapevine leaves in commercial vineyards throughout the California Central Valley, documenting the profound effects of these agricultural interventions that alter plant morphology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,084
Score d'incertitude au seuil0,167

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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