Geographic variation in the spotted-wing drosophila, <i>Drosophila suzukii</i> (Diptera: Drosophilidae), based on mitochondrial DNA sequences
Notice bibliographique
Résumé
The spotted-wing drosophila (SWD), Drosophila suzukii (Diptera: Drosophilidae), is an economically damaging pest that feeds on most thin-skinned fruits. It was originally native to a few Asian countries, including Korea, but is now found in North America and Europe. In this study, we sequenced portions of the mitochondrial (mt) COI and ND4 genes from a total of 195 individuals collected mainly from Korea. We then combined GenBank-registered COI sequences from all ancestral-range and introduced-range populations with our own COI data to assess the worldwide diversity, divergence, and relatedness of SWD haplotypes. A total of 139 haplotypes were obtained from the concatenated COI and ND4 sequences. Most haplotypes were confined to single localities, but 12 of them were found in more than two localities, and one haplotype (SWDCN61) was found from Korea to Canada. A dataset combining GenBank sequences with our own data identified a total of 94 worldwide COI haplotypes with a maximum sequence divergence (MSD) of 5.433% (32 bp). Although most haplotypes were found in only a single country, a few haplotypes were found commonly in China, Korea, and Japan; these occurred at a higher frequency and were often involved in introductions. A rough estimate of genetic diversity in each country showed higher diversity in ancestral distributional ranges, but the invasion over Asian countries seems to have been substantial because haplotype diversity was only 2.35 to 3.97-fold lower in the U.S.A, Canada, and Italy than that in the populations’ ancestral ranges.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».