Diversity, productivity and biomass of natural soil microbe communities (testate amoebae) under spatially and temporally variable salinization levels.
Notice bibliographique
Résumé
Overview:Diversity, productivity and biomass of natural soil microbe communities (testate amoebae) under spatially and temporally variable salinization levels, within coastal environments in the Magdalen Islands (Canada) and Marion Island (sub-Antarctica). See original article and 'Metadata' tab in the data-file for full description and methodology. Data compiled from published records of natural soil-dwelling testate amoeba (TA) communities, and includes 85 samples from four distinct transects of variable coastal salt-enrichment, at three independent coastal environment sites: * 31 samples from two transects across a salt-marsh in the Magdalen Islands, Canada (47.4oN, 61.9oW).* 26 samples from one transect across a brackish, tidal marsh (also in the Magdalen Islands, Canada).* 28 samples from one transect across a sub-Antarctic coastal peatland on Marion Island (46.9oS, 37.6oE). This dataset relates to the article: Whittle, A., Barnett, R. L., Charman, D., Gallego-Sala, A. V. (2021) Low-salinity transitions drive abrupt microbial response to sea-level change. Ecology Letters. List of data included (numbers relate to tabs in data-file): 1. Testate amoeba species relative abundance. Record for each individual testate amoeba taxon encountered within each sample. Expressed as a percentage (%) of the total community within each sample. See full article for details on actions taken for taxonomic standardisation. 2.1. Concentration (productivity) of individual testate amoeba taxa. Expressed as the number of shells per unit of sediment volume (i.e., tests cm-3). Concentration data includes shells of all living and dead (preserved) individuals encountered.2.2. Total concentration (productivity) of testate amoebae per site/sample. Expressed as the number of shells per unit of sediment volume (i.e., tests cm-3). Concentration data includes shells of all living and dead (preserved) individuals encountered. 3. Total biomass of testate amoebae per site/sample. Total biomass of live plus dead (preserved) testate amoebae within each surface sample. Expressed as μg Carbon cm-3 of sample. Biomass calculated from census counts of communities inhabiting surface soil samples (defined as the top-most 1 cm layer). 4. Environmental conditions at each site/sample-location. Measurements of pH and conductivity (salinity) - measured in μS. See article for full details on measurement methods. 5.1. Palaeo-record of changes in testate amoeba productivity in the brackish marsh at Bassin (Canada) since ~1700 CE. Expressed as the concentration of tests cm-3.5.2. Independent sea-level reconstruction from the brackish marsh at Bassin derived using Foraminifera. Independent sea-level reconstruction derived from the same core sequence at Bassin using Foraminifera. See original source: Barnett et al. (2017) Reconstructing late Holocene relative sea-level changes at the Magdalen Islands (Gulf of St. Lawrence, Canada) using multi-proxy analyses. J. Quat. Sci, 32(3): 380-395. 6.1. Palaeo-record of testate amoeba productivity in a salt-marsh at Les Sillons (Canada) since ~1700 CE. Expressed as the concentration of tests cm-3. 6.2. Independent sea-level reconstruction from the salt-marsh at Les Sillons derived using Foraminifera. Independent sea-level reconstruction derived from the same core sequence at Les Sillons using Foraminifera. See original source: Barnett et al. (2017) Reconstructing late Holocene relative sea-level changes at the Magdalen Islands (Gulf of St. Lawrence, Canada) using multi-proxy analyses. J. Quat. Sci, 32(3): 380-395.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».