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Enregistrement W4394135833 · doi:10.6084/m9.figshare.13603295

The lipoprotein NlpD in <i>Cronobacter sakazakii</i> responds to acid stress and regulates macrophage resistance and virulence by maintaining membrane integrity

2021· dataset· en· W4394135833 sur OpenAlexaff
Xuemeng Ji, Ping Lu, Juan Xue, Ning Zhao, Yan Zhang, Lu Dong, Xuejiao Zhang, Ping Li, Yaozhong Hu, Jin Wang, Bowei Zhang, Jingmin Liu, Huan Lv, Shuo Wang

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2021
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnterobacteriaceae and Cronobacter Research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirulenceCronobacter sakazakiiMembrane integrityMacrophageMicrobiologyChemistryMembraneBiologyFood scienceBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<i>Cronobacter sakazakii</i>, an emerging opportunistic pathogen, is implicated in severe foodborne outbreak infections in premature and full-term infants. Generally, acid tolerance is vital for the pathogenesis of foodborne pathogens; however, its role in <i>C. sakazakii</i> virulence remains largely unknown. To screen out acid-tolerance determinants from transposon mutants, anovel counterselection method using gentamicin and acid was developed. Using the counterselection method and growth assay, we screened several acid-sensitive mutants and found that <i>nlpD</i> encodes an acid-resistance factor in <i>C. sakazakii</i>. Compared to the wild-type strain, the <i>nlpD</i> mutant exhibited attenuated virulence in a rat model. Using macrophage THP-1 cells and a pH probe, we verified that <i>nlpD</i> enables bacteria to resist macrophages by resisting acidification. Finally, we confirmed that <i>nlpD</i> maintains <i>C. sakazakii</i> membrane integrity in acid using propidium iodide permeabilization assays via flow cytometry. Our results confirm that <i>nlpD</i> is a novel virulence factor that permits <i>C. sakazakii</i> to survive under acid stress conditions. Considering that NlpD is a conserved lipoprotein located in the bacterial outer membrane, NlpD could be used as a target for drug development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,074
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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