Additional file 2 of Comprehensive transcriptional variability analysis reveals gene networks regulating seed oil content of Brassica napus
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 2: Table S1. Genome-wide eQTLs identified at 20 DAF. Table S2. Genome-wide eQTLs identified at 40 DAF. Table S3. Genome-wide eGene-eQTLs identified at 20 DAF. Table S4. Genome-wide eGene-eQTLs identified at 40 DAF. Table S5. Results of GO enrichment analysis of specifically identified eGenes at 20 DAF. Table S6. Results of GO enrichment analysis of specifically identified eGenes at 40 DAF. Table S7. Summary of ATAC-Seq data. Table S8. List of homoeologous genes among subgenomes. Table S9. List of homoeologous genes on gene expression trend and regulation at 20 DAF. Table S10. List of homoeologous genes on gene expression trend and regulation at 40 DAF. Table S11. The information of hotspots at 20 DAF. Table S12. The information of hotspots at 40 DAF. Table S13. The list of TWAS significant genes of SOC and SGC at 20 DAF. Table S14. The list of TWAS significant genes of SOC and SGC at 40 DAF. Table S15. Enrichment analysis of eQTL hotspot regulatory genes in TWAS significant genes of SOC at 20 DAF. Table S16. Enrichment analysis of eQTL hotspot regulatory genes in TWAS significant genes of SOC at 40 DAF. Table S17. The results of Tomtom analysis of key sequences identified by Basenji module. Table S18. Primers for gene cloning and PCR confirmation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,750 | 0,154 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».