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Enregistrement W4394150938 · doi:10.6084/m9.figshare.22605205

Additional file 2 of Single-cell transcriptome analysis reveals liver injury induced by glyphosate in mice

2023· dataset· en· W4394150938 sur OpenAlexaff
Jiangpeng Wu, Xiuping Sun, Chun‐Yi Wu, Xiaoping Hong, Lulin Xie, Zixu Shi, Liang Zhao, Qingfeng Du, Wei Xiao, Jichao Sun, Jigang Wang

Notice bibliographique

RevueOpen MIND · 2023
Typedataset
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePesticide and Herbicide Environmental Studies
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlyphosateTranscriptomeLiver injuryCellBiologyCell biologyChemistryComputational biologyGeneticsBiotechnologyPharmacologyGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Additional file 2: Table S1. The top 100 genes for 13 major cell lineages. Table S2. The cell number for 13 major cell lineages. Table S3. The differentially expressed genes for 13 major cell lineages after glyphosate treatment. Table S4. The cell number for HSC cell subtypes. Table S5. The differentially expressed genes for HSC cell after glyphosate treatment. Table S6. The GO analysis for upregulated DEGs of HSC cells after GLY treatment. Table S7. The cell number for hepatocyte cell subtypes. Table S8. The differentially expressed genes for hepatocyte cell subtypes. Table S9. The differentially expressed genes for hepatocyte cell subtypes after GLY treatment. Table S10. The GO analysis for upregulated DEGs of hepatocyte cells after GLY treatment. Table S11. The cell number for Kupffer cell subtypes. Table S12. The average expression level of differentially expressed genes of KC4 cell for each sample. Table S13. The average fold change (avg_logFC) for differentially expressed cytokines of each Kupffer cell subtype after GLY treatment. Table S14. The average expression level of common differentially expressed genes of KC cell subtypes for each sample. Table S15. The cell number for LCM cell subtypes. Table S16. The differentially expressed genes for LCM cell subtypes after glyphosate treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,326
Score d'incertitude au seuil0,961

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,3260,086

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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