Contrasting histories of microcystin-producing cyanobacteria in two temperate lakes as inferred from quantitative sediment DNA analyses
Notice bibliographique
Résumé
Pilon S, Zastepa A, Taranu ZE, Gregory-Eaves I, Racine M, Blais JM, Poulain AJ, Pick FR. 2018. Contrasting histories of microcystin-producing cyanobacteria in two temperate lakes as inferred from quantitative sediment DNA analyses. Lake Reserv Manage. 35:102–117. The incidence and abundance of microcystin-producing cyanobacteria were compared between 2 temperate lakes over the past ∼150–175 yr by combining analyses of sediment DNA (qPCR of 4 target genes and high-throughput sequencing of a cyanobacterial 16S rRNA gene fragment) and sediment microcystin concentrations. In Lake of the Woods (LoW), toxic cyanobacteria were only detected beginning in the early 1980s based on gene copy numbers of the microcystin-synthesizing gene (mcyD), and by the early 2000s based on sediment microcystins; both these proxies for toxic cyanobacteria were significantly correlated. In contrast, in Baptiste Lake (Alberta), both mcyD gene copy numbers and microcystins were detected as far back as ∼1830, before European settlement of the region. Total sediment microcystins in this lake were not correlated with mcyD gene copy numbers, but the latter correlated with 2 other cyanobacterial genes targeted. These results point to a relatively recent emergence and increasing dominance of microcystin-producing cyanobacteria in LoW that coincides with the documented rise in regional temperatures rather than changes in nutrient loading. In contrast, toxic blooms are not a new phenomenon in Baptiste Lake, as microcystin-producing cyanobacteria were clearly part of the ecosystem prior to anthropogenic perturbations; this lake has also experienced a recent increase in microcystins coincident with further nutrient enrichment. High-throughput sequencing of the cyanobacterial 16S rRNA gene indicated that bloom-forming and potentially toxigenic Dolichospermum (including related Nostocales) and Microcystis were present but the former has been the dominant genus over the past 175 yr.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».