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Enregistrement W4394181086 · doi:10.6084/m9.figshare.15105232

A novel fusion circular RNA F-circBA1 derived from the <i>BCR-ABL</i> fusion gene displayed an oncogenic role in chronic myeloid leukemia cells

2021· dataset· en· W4394181086 sur OpenAlexaff
Yuan Tan, Zhenglan Huang, Xin Wang, Hongdan Dai, Guoyun Jiang, Wenli Feng

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2021
Typedataset
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Myeloid Leukemia Treatments
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFusion geneMyeloid leukemiaFusionCancer researchABLbreakpoint cluster regionLeukemiaGeneBiologyVirologyCell biologyGeneticsSignal transductionTyrosine kinase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The BCR-ABL fusion gene plays a crucial role in the leukemogenesis of chronic myeloid leukemia (CML). The BCR-ABL oncoprotein encoded by this fusion gene has been extensively studied. However, research on whether BCR-ABL also affects circular RNAs (circRNAs) is limited. This study aimed to explore the new fusion circRNAs produced by BCR-ABL and their role in CML cells. In this study, we identified a novel fusion circRNA, named F-circBA1, originating from BCR-ABL in K562 and K562/G01 cells using quantitative reverse transcriptase-polymerase chain reaction (qRT-PCR) and Sanger sequencing. qRT-PCR of the nuclear RNA and cytoplasmic RNA were separated, indicating that F-circBA1 was mainly localized in the cytoplasm. Cell counting kit-8 assay and flow cytometry showed that F-circBA1 knockdown by shRNA prevented the proliferation of K562 and K562/G01 cells, and the cell cycle was arrested at G2/M. Mechanically, dual-luciferase reporter assay and western blotting assay showed that F-circBA1 sponged miR-148-3p and F-circBA1 silencing decreased CDC25B expression in vitro. Furthermore, the results of the murine leukemogenesis model showed that F-circBA1 knockdown suppressed leukemogenesis in vivo. Besides, we found the existence of F-circBA1 in some patients with BCR-ABL-positive CML. In conclusion, these results demonstrate the presence of F-circBA1 and its oncogenic role in CML cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
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Résumé présentoui

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