A novel fusion circular RNA F-circBA1 derived from the <i>BCR-ABL</i> fusion gene displayed an oncogenic role in chronic myeloid leukemia cells
Notice bibliographique
Résumé
The BCR-ABL fusion gene plays a crucial role in the leukemogenesis of chronic myeloid leukemia (CML). The BCR-ABL oncoprotein encoded by this fusion gene has been extensively studied. However, research on whether BCR-ABL also affects circular RNAs (circRNAs) is limited. This study aimed to explore the new fusion circRNAs produced by BCR-ABL and their role in CML cells. In this study, we identified a novel fusion circRNA, named F-circBA1, originating from BCR-ABL in K562 and K562/G01 cells using quantitative reverse transcriptase-polymerase chain reaction (qRT-PCR) and Sanger sequencing. qRT-PCR of the nuclear RNA and cytoplasmic RNA were separated, indicating that F-circBA1 was mainly localized in the cytoplasm. Cell counting kit-8 assay and flow cytometry showed that F-circBA1 knockdown by shRNA prevented the proliferation of K562 and K562/G01 cells, and the cell cycle was arrested at G2/M. Mechanically, dual-luciferase reporter assay and western blotting assay showed that F-circBA1 sponged miR-148-3p and F-circBA1 silencing decreased CDC25B expression in vitro. Furthermore, the results of the murine leukemogenesis model showed that F-circBA1 knockdown suppressed leukemogenesis in vivo. Besides, we found the existence of F-circBA1 in some patients with BCR-ABL-positive CML. In conclusion, these results demonstrate the presence of F-circBA1 and its oncogenic role in CML cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».