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Enregistrement W4394186745 · doi:10.6084/m9.figshare.12859609

Validation of ulcerative colitis and Crohn’s disease and their phenotypes in the Danish National Patient Registry using a population-based cohort

2020· dataset· en· W4394186745 sur OpenAlexaboutno aff
Bobby Lo, Ida Vind, Marianne Kajbæk Vester-Andersen, Johan Burisch

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2020
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDanishUlcerative colitisCohortMedicinePatient registryCrohn's diseasePopulationInternal medicineCohort studyPhenotypeDiseaseEnvironmental healthBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Danish National Patient Registry (DNPR) has been the source of several epidemiological studies of inflammatory bowel disease (IBD). However, the validation dates back to 1996 and lacks outpatient records and disease classification. The aim of this study was to update the validation and assess the validity and reliability of using the registry in disease classification. Validation of the registry was done using a population-based inception cohort of IBD patients from 2003 to 2011 consisting of 513 patients. Specificity and sensitivity were calculated for the diagnoses of Crohn’s disease (CD) and ulcerative colitis (UC), age at diagnosis and disease classification according to the Montreal Classification at both time of diagnosis and end of follow-up. The registry showed high validity and reliability in identifying CD and UC patients concerning correct age classification and identifying perianal disease. The registry showed inconsistent, unreliable results in further disease classification. The DNPR has good validity and reliability in identifying patients with CD and UC, and defining the age of patients at diagnosis. However, categorising IBD patients according to the Montreal Classification should not be carried out using DNPR data in their current form, except when identifying CD patients with perianal disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,019
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil0,087

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,019
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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