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Enregistrement W4394188875 · doi:10.6084/m9.figshare.4595449

Correlation Between Cancer Research Trends and Real World Data: An Analysis on Altmetric Data

2017· dataset· en· W4394188875 sur OpenAlexaboutno aff
Peter Chou, Kevin Hong, Chandler Lei, Haolin Zhang

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2017
Typedataset
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlobal Cancer Incidence and Screening
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCorrelationReal world dataData scienceComputer scienceMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The field of cancer research is overall ambiguous to the general population and apart from medical news, not a lot is known of the proceedings. This study aims to provide some clarity towards cancer research, especially towards the correlations between research of different types of cancer. The amount of research papers pertaining to different types of cancers is compared against mortality and diagnosis rates to determine the amount of research attention towards a type of cancer in relation to its overall importance or danger level to the general population. This is achieved through the use of many computational tools such as Python, R, and Microsoft Excel. Python is used to parse through the JSON files and extract the abstract and Altmetric score onto a single CSV file. R is used to iterate through the rows of the CSV files and count the appearance of each type of cancer in the abstract. As well as this, R creates the histograms describing Altmetric scores and file frequency. Microsoft Excel is used to provide further data analysis and find correlations between Altmetrics data and Canadian Cancer Society data. The analysis from these tools revealed that breast cancer was the most researched cancer by a large margin with nearly 1,700 papers. Although there were a large number of cancer research papers, the Altmetric scores revealed that most of these papers did not gain significant attention. By comparing these results to Canadian Cancer Society data, it was uncovered that Breast Cancer was receiving research attention that was not merited. There were four times more breast cancer research papers than the second most researched cancer, prostate cancer. This was despite the fact that breast cancer was fourth in mortality and third in new cases among all cancers. Inversely, lung cancer was underrepresented with only 401 research papers in spite of being the deadliest cancer in Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,016
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,128
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Bibliométrie
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Évaluation · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,984
Score d'incertitude au seuil0,084

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0160,128
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0230,051
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,651
Tête enseignante GPT0,566
Écart entre enseignants0,086 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineÉvaluation
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
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Résumé présentoui

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