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Enregistrement W4394193059 · doi:10.6084/m9.figshare.19807913

Additional file 2 of Physiological and comparative transcriptome analyses reveal the mechanisms underlying waterlogging tolerance in a rapeseed anthocyanin-more mutant

2022· dataset· en· W4394193059 sur OpenAlexaff
Lina Ding, Rui Liu, Teng Li, Ming Li, Xiaoyan Liu, Weijie Wang, Yan-Kun Yu, Jun Cao, Xiaoli Tan

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2022
Typedataset
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant responses to water stress
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRapeseedWaterlogging (archaeology)MutantTranscriptomeAnthocyaninBiologyBrassicaHorticultureBotanyGeneticsGeneEcologyGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Additional file 2: Table S1. List of DEGs detected in the WT ZS11after the waterlogging treatment. Table S2. List of DEGs detected in the am mutant after the waterlogging treatment. Table S3. Differential expression of subclusters 1–5 in the am mutant. Table S4. Differential expression of subclusters 1–6 in the WT. Table S5. All the up- and downregulated DEGs with GO annotations in the am mutant. Table S6. All the up- and downregulated DEGs with GO annotations in the WT. Table S7. KEGG pathway enrichment of the DEGs in the WT. Table S8. KEGG pathway enrichment of the DEGs in the am mutant. Table S9. The DEG enrichment in the phenylalanine biosynthetic and metabolic pathways. Table S10. A list of differentially expressed TFs in the WT. Table S11. A list of differentially expressed TFs in the am mutant. Table S12. The DEG enrichment in plant hormone signal transduction pathways. Table S13. New transcript predictions as assessed by RNA-seq. Table S14. Primers used for qPCR validation of the selected DEGs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,444
Score d'incertitude au seuil0,792

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,4440,102

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,169
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,143 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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Résumé présentoui

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