Regional climate affects salmon lice dynamics, stage structure, and management
Notice bibliographique
Résumé
REGIONAL CLIMATE AFFECTS SALMON LICE DYNAMICS, STAGE STRUCTURE, AND MANAGEMENT<br>by Amy Hurford, Xiunan Wang, and Xiao-Qiang Zhao<br><br>Contact: Amy Hurford, ahurford@mun.ca<br><br>Several of these codes have dependencies on the PBSddesolve package.<br><br>CODE TO MAKE FIGURES (have dependencies on *.Rdata files)<br>(1) Figure1_map.R: makes FIGURE 1: Map and temperature and salinity plots<br>(2) Figure2_ParamsFunc.R: makes FIGURE 2: fits of functions for lab data describing life history parameters as a function of temperature and salinity. The output ParamsFunc.Rdata is called by subsequent codes.<br>(3) Figure3_R0Graphs.R makes FIGURE 3. This file calls Summary.Rdata, the output of R0Calcs.R. <br>(4) Figure3_R0Calcs.R: performs the calculations underlying FIGURE 3.<br>(5) Figure4_GenerationTime.R: makes FIGURE 4.<br>(6) FigureS1_NumericalMethods.R: makes FIGURE S1.<br><br>===============<br>DATA FILES<br>(7) Data_Extraction.csv: The raw data extracted from the sources as listed in Section S1 of Hurford et al.<br>Site abbreviations are described in detail in Section S1 of Hurford et al.<br>(8) CH.Rdata: Parameters and data for the site in Chile (CH). This file is called by other codes.<br>(9) IM3.Rdata: Parameters and data for the site a site off the coast of Ireland (IM3).<br>(10) IM4.Rdata: Parameters and data for the site a site off the coast of Ireland (IM4).<br>(11) farm24.Rdata: Parameters and data for the site in the Broughton Archipegalo (BCB).<br>(12) farmWCVI.Rdata: … for a site on the west coast of Vancouver Island (BCV).<br>(13) farmCC.Rdata: … for a site on the central coast of BC (BCC).<br>(14) farmNB.Rdata: … for a site in New Brunswick (NB).<br>(15) farmNS.Rdata: … for a site in Nova Scotia (NS).<br>(16) farmNL.Rdata: ... data is from Newfoundland (NL).<br>(17) farmNLI.Rdata: … for the Lista site in Norway (NLI).<br>(18) farmNIN.Rdata: … for the Ingoy site in Norway (NIN).<br>(19) ParamsFuncs.Rdata: Save parameterized functions (see Figure 2)<br>(20) Summary.Rdata: produced by Figure3_R0Calcs.R and loaded by Figure3_R0Graphs.R
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,299 | 0,015 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».