Influences of the diurnal cycle on gut microbiota in the Chinese swamp shrimp (<i>Neocaridina denticulata</i>)
Notice bibliographique
Résumé
The circadian rhythm is an essential environmental factor affecting several physiological activities in organisms, including crustaceans. However, daily variations in the gut bacterial community composition of crustaceans remain poorly understood. This study aimed to elucidate variations in the gut bacterial community composition of the Chinese swamp shrimp Neocaridina denticulata with the diurnal cycle. The gut samples of 600 shrimps were collected at four time points (6:00, 12:00, 18:00, and 24:00) within a 24 h period and 16S rRNA high-throughput gene sequencing was applied. The alpha-diversity and richness of the gut bacterial community were highest in the 24:00 group. Food digestion- and absorption-related pathways were highly enriched, indicating that metabolic process pathways are influenced by the daily cycle. Opportunistic pathogenic bacteria, including Flavobacterium, Acinetobacter, and Pseudomonas, were well-represented in the 18:00 and 24:00 groups, suggesting that the daily cycle shapes pathogenic bacterial community composition in the shrimp intestine. Our findings provide new insights into the role of diurnal cycles on gut bacteria in crustaceans and may aid in improving N. denticulata aquaculture.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».