Data and code from Rizzuto et al. “Forage stoichiometry predicts home range size in a small terrestrial herbivore"
Notice bibliographique
Résumé
Data and code used in Rizzuto et al. "Forage stoichiometry predicts home range size in a small terrestrial herbivore”. The “SupportingCode.html” file provides an in-depth description and discussion of our R workflow to estimate home range size of snowshoe hare and investigate its relationship with the ecological stoichiometry of preferred plant forage species. If you would like to reproduce our analyses, you can recompile the R notebook “SupportingCode.Rmd”. This is a modular document that collects the output of 8 other R notebooks. For correct compilation of the SupportingCode.Rmd file, please organize the files in this repository on your machine as follows: - all .Rmd and .R files in a "../Code/“ folder- all .csv files in a "../Data/" folder- all .tiff files in a “../Data/StDMs_Rasters/Ratios/" folder- unzip the SamplePoints.zip file in a "../Data/GridPoints/" folder- all .rds files in a "../Results/" folder Where the Code, Data, and Results folder all share the same root. Please note that access to some shapefiles used to produce the maps in the manuscript, SI, or Supporting Code document was regulated by agreements with the Government of Newfoundland and Labrador and the Federal Government of Canada. As such, they could not be publicly shared. This does not impact the analyses, only the production of some visual supporting material (e.g., study area maps). Please contact the corresponding author (M. Rizzuto) for any question. See README.md for details on the repository’s contents.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,019 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,340 | 0,255 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».