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Enregistrement W4394216893 · doi:10.6084/m9.figshare.19361672

CircCDR1 sponges miR-1290 to regulate cell proliferation, migration, invasion, and apoptosis in esophageal squamous cell cancer

2022· dataset· en· W4394216893 sur OpenAlexaff
Yong Fang, Jun Yin, Ya-Xing Shen, Hao Wang, Han Tang, Xiaosang Chen

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2022
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCircular RNAs in diseases
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSquamous cell cancerApoptosisCancer researchEsophageal cancerCellEsophageal squamous cell carcinomaCell growthBasal cellCell migrationCancerBiologyMedicinePathologyInternal medicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Since circCDR1 was abnormally expressed in esophageal squamous cell cancer (ESCC), the current study explored whether circCDR1 affected ESCC. Detailedly, circCDR1 expression in ESCC and linear isoform and stability of circCDR1 were detected by RT-qPCR. The location of circCDR1 was detected by fluorescence <i>in situ</i> hybridization (FISH). After transfection, the cell biological functions were detected by wound-healing, CCK-8, colony formation, and flow cytometry assays. The target of circCDR1 was predicted by bioinformatics, FISH, RNA pull-down, and dual-luciferase reporter assays. The correlation between circCDR1 and miR-1290 was analyzed by Pearson’s correlation analysis. A subcutaneous-xenotransplant tumor model in BALB/c nude mice was established and the levels of circCDR1, miR-1290, and apoptosis/metastasis/proliferation-related factors in the cancer cells and tissues were detected by immunohistochemical analysis, western blot, or RT-qPCR. As a result, circCDR1 was low-expressed in ESCC tissues and cells, while miR-1290 was high-expressed. CircCDR1 was regulated and was negatively correlated with miR-1290. CircCDR1, located in cytoplasm, inhibited the viability, proliferation, migration, and invasion of the cancer cells and the expressions of Bcl-2, N-cadherin, and Vimentin, but enhanced cell apoptosis and the expressions of C caspase-3, Bax, E-cadherin, IGFBP4, LHX6 and NFIX. <i>In vivo</i>, circCDR1 promoted xenotransplanted tumor weight and volume, and the expressions of C caspase-3 and Bax yet suppressed the levels of Bcl-2, miR-1290, and Ki-67 in tumor tissues. The effects of circCDR1 on both cancer cells and tissues were opposite to and reversed by miR-1290 mimic. Collectively, circCDR1 sponged miR-1290 to regulate the progression of ESCC both <i>in vitro</i> and <i>in vivo</i>.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,089
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0890,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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Résumé présentoui

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