Additional file 2 of Circulating inflammatory cytokines and risk of five cancers: a Mendelian randomization analysis
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 2. (Supplemental Tables): Supplementary Table 1. Sources of GX instruments per cytokine & genetic locus of cytokine. Supplementary Table 2. Genetic association estimates that were used in the MR analyses. Supplementary Table 3. Sources of GY instruments per cancer outcome. Supplementary Table 4. Genetic association estimates that were used in the MR analyses. Supplementary Table 5. Summary of the MR results based on the cis-pQTL instrument definition. Supplementary Table 6. Summary of the MR results based on the cis-eQTL instrument definition. Supplementary Table 7. Identification of druggable targets using publicly available repositories. Supplementary Table 8. Summary of epidemiological evidence linking prediagnostic cytokine concentrations to cancer risk. Supplementary Table 9. KeGG pathways in which significant cytokines are involved. Supplementary Table 10. Colocalization analysis. Supplementary Table 11a. Secondary cytokines associated with selected instruments, based on the gwas included in the study. Supplementary Table 11b. Secondary traits associated with selected instruments, based on a phenoscanner search. Supplementary Table 12a. Sensitivity analyses excluding potentially pleiotropic genetic variants. Supplementary Table 12b. Sensitivity analyses accounting for LD among genetic variants. Supplementary Table 13. Replication of the significant associations in the UK Biobank.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,023 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,548 | 0,057 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».