MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4394347704 · doi:10.6084/m9.figshare.24123923

Additional file 6 of Analysis of DNA methylation at birth and in childhood reveals changes associated with season of birth and latitude

2023· dataset· en· W4394347704 sur OpenAlexaff
Latha Kadalayil, Md. Zahangir Alam, Cory White, Akram Ghantous, Esther Walton, Olena Gruzieva, Simon Kebede Merid, Ashish Kumar, Ritu Roy, Olivia Solomon, Karen Huen, Brenda Eskenazi, Peter Rzehak, Veit Grote, Jean‐Paul Langhendries, Elvira Verduci, Natàlia Ferré, Lu Gao, Weihua Guan, Xuehuo Zeng, Enrique F. Schisterman, John Dou, Kelly M. Bakulski, Jason I. Feinberg, Munawar Hussain Soomro, Giancarlo Pesce, Nour Baïz, Elena Isaevska, Michelle Plusquin, Marina Vafeiadi, Theano Roumeliotaki, Sabine A. S. Langie, Arnout Standaert, Catherine Allard, Patrice Perron, Luigi Bouchard, Evelien R. van Meel, Janine F. Felix, Vincent W. V. Jaddoe, Paul Yousefi, Cecilia Høst Ramlau‐Hansen, Caroline L. Relton, Elmar W. Tobi, Anne P. Starling, Ivana V. Yang, Maria Llambrich, Gillian Santorelli, Johanna Lepeule, Lucas A. Salas, Mariona Bustamante, Susan Ewart, Hongmei Zhang, Wilfried Karmaus, Stefan Röder, Ana Claudia Zenclussen, Jianping Jin, Wenche Nystad, Christian M. Page, Maria C. Magnus, Dereje D. Jima, Cathrine Hoyo, Rachel L. Maguire, Tuomas Kvist, Darina Czamara, Katri Räikkönen, Tong Gong, Vilhelmina Ullemar, Sheryl L. Rifas‐Shiman, Emily Oken, Catarina Almqvist, Robert Karlsson, Jari Lahti, Susan K. Murphy, Siri E. Håberg, Stephanie J. London, Gunda Herberth, Syed Hasan Arshad, Jordi Sunyer, Regina Gražulevičienė, Dana Dabelea, Régine P.M. Steegers‐Theunissen, Ellen A. Nøhr, Thorkild I. A. Sørensen, Liesbeth Duijts, Marie‐France Hivert, Vera Nelen, Maja Popović, Manolis Kogevinas, Tim S. Nawrot, Zdenko Herceg, Isabella Annesi‐Maesano, M. Daniele Fallin, Edwina Yeung, Carrie V. Breton, Berthold Koletzko, Nina Holland, Joseph L. Wiemels, Erik Melén, Gemma C. Sharp, Matt J. Silver, Faisal I. Rezwan, John W. Holloway

Notice bibliographique

RevueDocument Server@UHasselt (UHasselt) · 2023
Typedataset
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBirth, Development, and Health
Établissements canadiensCentre de Santé et de Services Sociaux de ChicoutimiCentre Intégré Universitaire de Santé et de Services Sociaux du Saguenay–Lac-Saint-JeanUniversité de SherbrookeCentre Hospitalier Universitaire de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSeason of birthDNA methylationLatitudeGeneticsBiologyGeographyGeneAnimal science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Additional file 6. Table S5: “Genes mapped to DMP/DMR identified in at-birth samples of babies born in the latitude ≥ 50°N and some examples of their associations with biological functions”. Provides examples of known functional associations of genes mapped to significant CpG sites or differentially methylated regions identified in this study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,446
Score d'incertitude au seuil0,791

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,4460,105

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueDocument Server@UHasselt (UHasselt)Même sujetBirth, Development, and HealthTravaux en français237 207