Climate change contributes to widespread declines among bumble bees across continents - DATA REPOSITORY
Notice bibliographique
Résumé
Data and code repository for Soroye et al. 2020. (DOI: 10.1126/science.aax8591)Gridded environmental observations and R scripts used to process data and generate all results from study. The bumblebee dataset has been previously used in Kerr et al 2015, and contains data assembled from a variety of sources including (Polce et al 2018, Rasmont et al 2015, Potts et al 2015, and Williams et al 2014), and other sources listed in the complete acknowledgement below. This data is provided in accordance with the Research Standards and data policies of Science, to allow any researchers to reproduce or extend the analysis. Researchers wishing to use these data for novel applications or questions should first seek permission from the original data providers (see complete acknowledgement below for a list). J. T. Kerr, A. Pindar, P. Galpern, L. Packer, S. G. Potts, S. M. Roberts, P. Rasmont, O. Schweiger, S. R. Colla, L. L. Richardson, D. L. Wagner, L. F. Gall, D. S. Sikes, A. Pantoja, Climate change impacts on bumblebees converge across continents. Science 349, 177–180 (2015). doi:10.1126/science.aaa7031 C. Polce, J. Maes, X. Rotllan-Puig, D. Michez, L. Castro, B. Cederberg, L. Dvorak, Ú.Fitzpatrick, F. Francis, J. Neumayer, A. Manino, J. Paukkunen, T. Pawlikowski, S. Roberts, J. Straka, P. Rasmont, Distribution of bumblebees across europe. One Ecosyst. 3, e28143 (2018). doi:10.3897/oneeco.3.e28143S. G. Potts, J. C. Biesmeijer, R. Bommarco, A. Felicioli, M. Fischer, P. Jokinen, D. Kleijn,A.-M. Klein, W. E. Kunin, P. Neumann, L. D. Penev, T. Petanidou, P. Rasmont, S. P. M. Roberts, H. G. Smith, P. B. Sørensen, I. Steffan-Dewenter, B. E. Vaissière, M. Vilà, A. Vujić, M. Woyciechowski, M. Zobel, J. Settele, O. Schweiger, Developing European conservation and mitigation tools for pollination services: Approaches of the STEP (Status and Trends of European Pollinators) project. J. Apic. Res. 50, 152–164 (2015). doi:10.3896/IBRA.1.50.2.07P. H. Williams, R. W. Thorp, L. L. Richardson, S. R. Colla, Bumble Bees of North America:An Identification Guide (Princeton Univ. Press, 2014).P. Rasmont, M. Franzen, T. Lecocq, A. Harpke, S. Roberts, K. Biesmeijer, L. Castro, B.Cederberg, L. Dvorak, U. Fitzpatrick, Y. Gonseth, E. Haubruge, G. Mahe, A. Manino, D. Michez, J. Neumayer, F. Odegaard, J. Paukkunen, T. Pawlikowski, S. Potts, M. Reemer,J. Settele, J. Straka, O. Schweiger, Climatic Risk and Distribution Atlas of European Bumblebees. BioRisk 10, 1–236 (2015). doi:10.3897/biorisk.10.4749 The authors would like to thank all contributors to the bumble bee dataset, and the tireless hours of those who helped put it together, especially Alana Pindar, Paul Galpern, Laurence Packer, Simon G. Potts, Stuart M. Roberts, Pierre Rasmont, Oliver Schweiger, Sheila R. Colla, Leif L. Richardson, David L. Wagner, Lawrence F. Gall, Derek S. Sikes, and Alberto Pantoja. We are grateful to data contributors from North America: Bee Biology and Systematics Lab, USDA-ARS, Utah State University; John Ascher, National University of Singapore and American Museum of Natural History, New York, USA; Doug Yanega, University of California, Riverside (NSF-DBI #0956388 and #0956340), California, USA; Illinois Natural History Survey, Illinois, USA; Packer Lab Research Collection, York University, Canada; Canadian National Collection, Agriculture and Agri-Food Canada; Canada; Peabody Museum, Yale University; Sam Droege, USGS Patuxent Wildlife Research Center, USA; Boulder Museum of Natural History, University of Colorado, Colorado, USA. From Europe: Status and Trends of European Pollinators (STEP) Collaborative Project (grant 244090, www.STEP-project.net); Bees, Wasps and Ants Recording Society; BDFGM Banque de Données Fauniques (P. Rasmont & E. Haubruge); BWARS (UK, S.P.M. Roberts); SSIC (Sweden, B. Cederberg); Austria (J. Neumayer); EISN (Netherland, M. Reemer); CSCF (Suisse, Y. Gonseth); Poland (T. Pawlikowski); NBDC (Eire, U. FitzPatrick); FMNH (Finland, J. Paukkunen); Czech Republic (J. Straka, L. Dvorak); France (G. Mahé); NSIC (Norway, F. Odegaard); UK (S.P.M. Roberts); Italy (A. Manino); Spain (L. Castro) Global Biodiversity Information Facility (GBIF), http://gbif.org for records from North America and Europe.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,019 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,009 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,170 | 0,068 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».