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Enregistrement W4394363928 · doi:10.6084/m9.figshare.8139368.v3

Hsa_circ_0101432 promotes the development of hepatocellular carcinoma (HCC) by adsorbing miR-1258 and miR-622

2022· dataset· en· W4394363928 sur OpenAlexaff
Haibo Zou, Xiangang Xu, Lanyun Luo, Yu Zhang, Le Luo, Yutong Yao, Guangming Xiang, Xiaolun Huang, Guan Wang

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2022
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCircular RNAs in diseases
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHepatocellular carcinomamicroRNACancer researchBiologyInternal medicineMedicineGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The present research was major in investigating the regulation association among hsa_circ_0101432 (has_circ_RPPH1), miR-1258, miR-622 and MAPK1 in hepatocellular carcinoma (HCC), and we explored the mechanism underlying pathogenesis of HCC. Microarray analysis was employed to detect hsa_circ_0101432 expression in HCC. Hsa_circ_0101432 was verified as a circRNA by testing divergent primers and RNase R. And qRT-PCR was performed to determine the expression of hsa_circ_0101432, miR-1258, miR-622 and MAPK1 mRNA. Furthermore, miRanda predicted that mRNAs targeted miR-1258 and miR-622. CCK-8 assay, colony formation assay, flow cytometry as well as transwell assay were performed to detect cell viability, proliferation, apoptosis and invasive ability, respectively. Xenograft in nude mice was applied to observe tumor growth in vivo. Up-regulated hsa_circ_0101432 and down-regulated miR-1258 and miR-622 were detected in HCC while Hsa_circ_0101432 enhanced expression of MAPK1 mRNA by targeting miR-1258 and miR-622. Knocking down hsa_circ_0101432 or overexpressing miR-1258 and miR-622 inhibited proliferation and invasive ability of HCC cell and promoted cell apoptosis. Hsa_circ_0101432 was confirmed to promote tumor growth via inhibiting miR-1258 and miR-622 expression and promoting MAPK1 mRNA expression by in vivo experiment. Hsa_circ_0101432 inhibited HCC cell apoptosis, promoted cell proliferation, invasive ability and HCC tumor growth by targeting miR-1258 and miR-622 and upregulating MAPK1 mRNA expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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