MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4394369675 · doi:10.6084/m9.figshare.14068007

Additional file 2 of Development of genome-wide polygenic risk scores for lipid traits and clinical applications for dyslipidemia, subclinical atherosclerosis, and diabetes cardiovascular complications among East Asians

2021· dataset· en· W4394369675 sur OpenAlexaff
Claudia H.T. Tam, Cadmon K.P. Lim, Andrea O. Y. Luk, Alex C.W. Ng, Heung Man Lee, Guozhi Jiang, Eric S. H. Lau, Baoqi Fan, Raymond Wan, Alice P.S. Kong, Wing Hung Tam, Risa Ozaki, Elaine Chow, Ka-Fai Lee, Shing‐Chung Siu, Grace Hui, Chiu-Chi Tsang, Kam-Piu Lau, Jenny Leung, Man-Wo Tsang, Grace Kam, Ip Tim Lau, June K.Y. Li, Ming Wai Yeung, Emmy Lau, Stanley Lo, Samuel Fung, Yuk‐Lun Cheng, Chun‐Chung Chow, Miao Hu, Weichuan Yu, Stephen Kwok‐Wing Tsui, Yu Huang, Cheuk‐Chun Szeto, Nelson L.S. Tang, Maggie C. Y. Ng, Wing‐Yee So, Brian Tomlinson, Juliana C.N. Chan, Ronald C.W.

Notice bibliographique

RevueOpen MIND · 2021
Typedataset
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipoproteins and Cardiovascular Health
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDyslipidemiaSubclinical infectionPolygenic risk scoreDiabetes mellitusMedicineInternal medicineBioinformaticsBiologyGeneticsGeneEndocrinologyGenotypeSingle-nucleotide polymorphism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Additional file 2: Table S1. Clinical characteristics of all participants. Table S2. Correlations of candidate polygenic risk scores with total cholesterol in validation datasets. Table S3. Correlations of candidate polygenic risk scores with triglyceride levels in validation datasets. Table S4. Correlations of candidate polygenic risk scores with HDL cholesterol in validation datasets. Table S5. Correlations of candidate polygenic risk scores with LDL cholesterol in validation datasets. Table S6. Correlations between measured lipid traits and polygenic risk scores derived by using the genome-wide significant variants identified in European populations. Table S7. Prediction ability of the best polygenic risk scores for abnormal lipid levels in testing datasets. Table S8. Prediction ability of the best polygenic risk scores for abnormal lipid levels in validation datasets. Table S9. Baseline and follow-up clinical characteristics of the adolescents included in the assessment of three-year changes for lipid traits. Table S10. Clinical characteristics of the adult women included in the assessment of intima-media thickness. Table S11. Clinical characteristics of the T2D patients included in the assessment of coronary heart disease. Table S12. Association between coronary heart disease and quintiles of polygenic risk scores in T2D patients. Table S13. Correlations of candidate polygenic risk scores with total cholesterol in T2D patients. Table S14. Correlations of candidate polygenic risk scores with triglyceride levels in T2D patients. Table S15. Correlations of candidate polygenic risk scores with HDL cholesterol in T2D patients. Table S16. Correlations of candidate polygenic risk scores with LDL cholesterol in T2D patients. Table S17. Baseline clinical characteristics of the adolescents stratified by the status of follow-up.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,048
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,780
Score d'incertitude au seuil0,314

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,048
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,7800,098

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueOpen MIND→Même sujetLipoproteins and Cardiovascular Health→Travaux en français237 207→