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Enregistrement W4394372860 · doi:10.6084/m9.figshare.22601513

Additional file 2 of Integrated single-molecule real-time sequencing and RNA sequencing reveal the molecular mechanisms of salt tolerance in a novel synthesized polyploid genetic bridge between maize and its wild relatives

2023· dataset· en· W4394372860 sur OpenAlexaff
Xiaofeng Li, Xingyu Wang, Qiang‐Qiang Ma, Yunfeng Zhong, Yibo Zhang, Ping Zhang, Yingzheng Li, Ruyu He, Yang Zhou, Yang Li, Mingjun Cheng, Yan Xu, Yan Li, Jianmei He, Muhammad Zafar Iqbal, Tingzhao Rong, Qilin Tang

Notice bibliographique

RevueOpen MIND · 2023
Typedataset
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensMcGill UniversityCentre for Interdisciplinary Research in Rehabilitation
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPolyploidBiologyGeneticsDNA sequencingRNAComputational biologyGeneGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Additional file 2: Table S1. SMRT sequences summary. Table S2. Statistics of unigenes unmapped to maize. Table S3. Functional annotation of unigenes unmapped to maize. Table S4. Orthologous groups in nine grass species according to maize (Mo17 and B73)-MTP-T. dactyloides ortholog relationships. Table S5. Statistics of orthologous gene set between MTP and nine grass species. Table S6. Summary statistics of RNA sequencing data. Table S7. Comparison of copy numbers of gene families in MTP that are involved in salt-saline tolerance with other species. Table S8. Expression patterns of genes in MTP that are involved in salt-saline tolerance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,394
Score d'incertitude au seuil0,864

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,3940,108

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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Résumé présentoui

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