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Enregistrement W4394385066 · doi:10.6084/m9.figshare.2008209

Supplementary data

2015· dataset· en· W4394385066 sur OpenAlexaboutno aff
Tracy R. Melzer

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2015
Typedataset
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This spreadsheet holds the data used in the manuscript. The following list explains column names: (see ReadMe.doc for more information).subject: Each subject has a unique letter identifierAnonID: Anonymous IDGroup: PD or ControlCategory: Cognitive category. PDN = PD with normal cognition, PD-MCI = PD with Mild Cognitive Impairment, PDD = PD with dementia, HC = healthy control.Category_HC-MCI: Cognitive category. However, this time 3 controls classified as MCI are identified (C-MCI). Convert: The status of each individual at 1 year follow up. HC = healthy control, Stable = Did not develop dementia, Convert = Developed dementia at 1 year. Age_at_scan_years: Age at assessment/scanAge_base: Age as study entrytime_btw_scans_years: Time between scans measured in years.Female: 0 = male, 1 = femaleEducation: years of educationFU_1year: 1st or 2nd scantime: assessment time, either baseline (study entry) or follow up (~ 1year).time.y: time, in years, of follow up.GM_order.diff.and.avg: Subject order of the 4D files associated with grey matter (swarate_GM_44.nii.gz, swavg_GM_44.nii.gz).Exclude.motion.T1: T1 images excluded due to motion at Y0 or Y1.TBSS_order.diff.and.avg: Order of the 4D image files associated with DTI and TBSS.ASL_order.diff: Subject order of the 4D image file (sdiff_wecqCBF_43.nii.gz:).ASL_order_avg.part1: Subject order of the 4D image files (demeaned_swecqCBF_43_base_part1.nii.gz, savg_wecqCBF_43_part1.nii.gz).ASL_order_avg.part2: Subject order of the 4D image files (demeaned_swecqCBF_43_base_part2.nii.gz, savg_wecqCBF_43_part2.nii.gz).SIENA: % brain change between scans. Values only at baseline (first timepoint).DTI relative motion: average relative motion between adjacent diffusion volumes (see manuscript for details).mean FA/MD/L1/RD: mean FA /MD/L1/RD values along the white matter skeleton CBF_gm: mean grey matter perfusion (ml/100g/min), including cortex and subcortical grey.diff.FA.Y0-Y1 (same for MD/CBF): raw difference between mean FA at Y0 and Y1.per.diff.FA.Y0-Y1 (same for MD/CBF): percent difference between mean FA at Y0 and Y1.per.diff.year.FA.Y0-Y1 (same for MD/CBF): percent difference between mean FA at Y0 and Y1, divided by the time between Y0 and Y1.MoCa: Montreal cognitive assessment—global cognitive screen.UPDRS Part 3: Unified Parkinson’s disease rating scale, part 3, the motor score (only scores for PD participants).LED: Levodopa equivalent dose.Attention Total: average z score for tests in the domain of attention, working memory, and processing speed. Executive Function Total: average z score for tests in the domain of executive function.Visuo-Total: average z score for tests in the domain of visuospatial/visuoperceptual function.Language all Domains: average z score for tests in the domain of Language. Total all Domains: global cognitive score: average z score for the domain scores (attention, executive function, learning & memory, and visuospatial/perceptual)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,042
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,131
Score d'incertitude au seuil0,186

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,042
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0060,005
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0050,003
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,8690,533

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,169
Tête enseignante GPT0,416
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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Résumé présentoui

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