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Enregistrement W4394393785 · doi:10.6084/m9.figshare.19650841

Delivery prediction by quantitative analysis of four steroid metabolites with liquid chromatography tandem mass spectrometry in asymptomatic pregnant women

2022· dataset· en· W4394393785 sur OpenAlexaff
Lanlan Meng, Shaofei Su, Lin Li, Shengmin Liu, Youran Li, Ying Liu, Yifan Lu, Zhengwen Xu, Lin Liu, Qixin He, Yuanyuan Zheng, Xiaowei Liu, Yuting Cong, Yanhong Zhai, Zhen Zhao, Zheng Cao

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2022
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChromatographyLiquid chromatography–mass spectrometryTandem mass spectrometryAsymptomaticMass spectrometrySteroidChemistryMedicineInternal medicineBiochemistryHormone

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prediction of delivery is important for assessing due dates, providing adequate prenatal care, and suggesting appropriate interventions in preterm and post-term pregnancies. Recent metabolomic findings suggested that the temporal abundance information of metabolome can be used to predict delivery timing with high accuracy in a cohort of healthy women. However, a targeted and quantitative assay is required to further validate the clinical performance and utility of this group of metabolomic candidates in delivery prediction with a larger and independent cohort. LC-MS/MS quantitative assays were applied to determine the plasma concentrations of four steroid metabolites, including oestriol-16-glucuronide (E3-16-Gluc), 17-alpha-hydroxyprogesterone (17-OHP), tetrahydrodeoxycorticosterone (THDOC), and androstane-3,17-diol (A-3,17-Diol) in asymptomatic women of singleton pregnancies (≥30th gestational weeks). Subsequent statistical analysis was conducted to assess the performance of the above candidates in delivery prediction. Using LC-MS/MS, four steroids were separated and quantified in 5.5 min. The coefficients of variation (CVs) of the four analytes at the lower limit of quantification ranged from 7.9% to 14.6%, with the R2 values greater than 0.990 in the calibration curves. Of the 585 recruited pregnant women who ended up with spontaneous delivery, 17.1% and 82.9% of the subjects delivered within and after 7 days since plasma collection, respectively. In the receiver operator curve analysis, the gestational age-adjusted area under the curve of the combined measurements of E3-16-Gluc and 17-OHP was 0.69 (95% CI: 0.60–0.76), with the sensitivity of 87.0% (95% CI: 78.8%–92.9%) and specificity of 60.2% (95% CI: 55.7%–64.6%). Moreover, the positive and the negative predictive values were 28.3%–34.0% and 93.1%–97.4% respectively for this combined panel. We performed analytical and clinical validation of a quantitation LC-MS/MS panel for the four steroids in the plasma of pregnant women. The steroid metabolites panel of E3-16-Gluc and 17-OHP was potentially useful for predicting delivery within one week in asymptomatic women of singleton pregnancies. Key messagesA quantitative LC-MS/MS assay for determining the plasma levels of 17-OHP, THDOC, A-3,17-Diol and E3-16-Gluc was developed and validated, in order to evaluate their predictive performance in asymptomatic delivery of singleton pregnancy. The levels of E3-16-Gluc and 17-OHP were found to be significantly elevated at the time of sampling in women that delivered within one week and their combinational testing may be potentially useful in delivery prediction. A quantitative LC-MS/MS assay for determining the plasma levels of 17-OHP, THDOC, A-3,17-Diol and E3-16-Gluc was developed and validated, in order to evaluate their predictive performance in asymptomatic delivery of singleton pregnancy. The levels of E3-16-Gluc and 17-OHP were found to be significantly elevated at the time of sampling in women that delivered within one week and their combinational testing may be potentially useful in delivery prediction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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